Re: [討論] miniPCR: A DNA Discovery System

[Shilia (us, together)]

※ 引述《ggg12345 (ggg)》之銘言：
: 謝謝您的說明.
: 這個設備怎麼看, 都看不出要耗$549才能做出來用. 比較先進的地方是那個反覆
: copy 是個有溫度控制的分離, 再製. 特點是可透過手機做程序控制. 最後段是電
: 泳, 螢光標記與分析, 應該也有可能用手機對螢光照相分析才是. 類似的教學用
: 實驗儀器, 台灣應該也可以做出來.

  $549 已經比台製 96well 的 PCR 機器便宜很多囉（雖然這 miniPCR 沒到 96well）

  那說明看來應該是可透過電腦 (Windows & Mac) 和手機 (iPhone & Android) 做傳
  統上是在 PCR machine 上操作的程序設定。所以 miniPCR 不需要內建 Windows 作
  業系統也不需要顯示螢幕和觸控面板或鍵盤，純粹就剩下跑 PCR 的 "機器"。

  照膠系統也是做成用手機就可以直接拍照存檔（← 我沒看到軟體長怎樣，但我猜應
  該沒特別寫個 "分析" 程式，因為一般跑 PCR 就是看有沒有跑出自己想要的 band，
  不是拿來做定量用的 ）

  $549 這價格，買一台台製的數位照膠系統都還不夠喔！
  是說我很久沒問新機的價格了，因為 PCR machine 和數位照膠系統都是種買一次就
  可以用很久的東西。

  跑 PCR 溫度精確很重要。翻了一下網路上的文件 (http://goo.gl/gCT9UZ)，這台
  應該有辦法做 temperature gradient 去抓 PCR 需要的 annealing temp (比較古
  早的 PCR 機器不見得有這功能)。對窮實驗室或窮學校來說，這價格算很實惠啦！


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※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/AfterPhD/M.1415893820.A.A23.html
推 jabari: 三個恆溫水浴槽 + 一個大學供毒生
→ jabari: 比起這個 我比較推LAMP的快速診斷  不過得請別人抓條件@@
→ Shilia: 欸我讀文獻時看到 LAMP 也覺得很喜歡。不過台灣有人在用
→ Shilia: 這做實驗嗎 (就是 "有沒有口碑客戶的論文可以參考的" ?)
→ Shilia: 因為沒有機會用過的東西很難去想說要生出什麼樣的改良版
→ Shilia: 三個恆溫水浴槽做 PCR 這件事我真的有試過喔 (我待過一間
→ Shilia: 有一大堆古董設備囤積在櫃子裡頭、又只有兩個人在做實驗的
→ Shilia: 實驗室。所以有機會嘗試一堆克難又很便宜的方法做實驗) 結
→ Shilia: 論是如果本來就比較不好 P 的 PCR，機器都難跑了就不要為
→ Shilia: 難大學工讀生了 :P
推 jabari: LAMP目前多為碩論...因為主要應用群是鎖定需田野調查的實
→ jabari: 驗...不過老師們更多傾向採樣回家作
推 ggg12345: 請教一下為甚麼要複製2**32,才能做識別或定序?
→ ggg12345: 像交大那個神研究,用啥原理對單基因體做定序?拉直比對?
→ Shilia: j大：我相信 "老師們傾向採樣回家做" 這一點，因為基因體
→ Shilia: 醫學也會有要收案的研究護理師，他們那也叫 "田野調查"
→ Shilia: 抽回來的個案血液檢體是醫生的寶貝，可以用來做很多 GWAS
→ Shilia: 還 NGS 分析，如果讓學生在外頭定幾個基因序列定完就算了
→ Shilia: 那以後就沒籌碼跟人家談合作研究和掛名啦
→ Shilia: g大：我猜您的問題點應該在要跑 PCR 會需要一定量的 DNA。
→ Shilia: 現今台灣生醫實驗室最常見的做法是把 PCR 產物送去做
→ Shilia: Sanger sequencing (步驟可參考 http://goo.gl/lh4NGE)
→ Shilia: Sanger sequencing 和單細胞基因定序都需要經過 PCR 步驟
→ Shilia: 所以有在發展單細胞基因定序技術的人都會知道一個雙套染色
→ Shilia: 體的人類細胞大概有 7pg 的染色體 DNA，mRNA 更是少於 1pg
→ Shilia: 一定要先放大才足夠現有的定序技術進行 Library 的製備。
→ Shilia: 交大那超過物理學極限的神研究就別看了吧，真要發展單細胞
→ Shilia: 基因定序技術當然是要從理論和實作技術已被接受的文獻和專
→ Shilia: 利唸起。奠基在假 data 上是絕對不會有啥改變世界的突破的
→ ggg12345: 感覺PCR反覆複製是為了定點切斷,供電泳後,量夠著色顯影
→ ggg12345: 如果交大的蛋白質電晶體讓電泳排列的基因體因磁場順排而
→ ggg12345: 觸發偵測出來,那是有可能不必如此多次費時反覆高量複製.
→ jabari: 有夢最美  希望相隨   ......... 什麼時候可以超時空warp?