Re: [轉錄][求救] 有關FASTA format

[TZUKI (漢堡)]

不好意思

我可能沒有說清楚

現在是   如果有人丟了以下一串東西給我

MAAIASTLSLSSTKPQRLFDSSFHGSAISAAPISIGLKPRS
FSVRATTAGYDLNAFTFDPIKESIVSREMTRRYMTDMITYAETDVVVVGAGSAGLSAAYEISKNPNVQVAIIEQSVSPGGGAWLGGQLFSAMIVRKPAH
LFLDEIGVAYDEQDTYVVVKHAALFTSTIMSKLLARPNVKLFNAVAAEDLIVKGNRVGGVV
TNWALVAQNHHTQSCMDPNVMEAKIVVSSCG
HDGPFGATGVKRLKSIGM
IDHVPGMKALDMNTAEDAIVRLTREVVPGM

像這種亂糟糟的感覺

而一般fasta格式通常是80或70個在一個column裡面

而我應該如何將上面這組東西變成標準的格式??

希望有人可以分享經驗m(_ _)m

--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 134.208.44.23
推 tinin:這是一條序列還是多條序列?
→ TZUKI:多條
→ TZUKI:他們原本都是正式的fasta format  但是變成這副德行= =
→ auymle:轉成fasta的目的是什麼阿...不然一般的程式直接把序列
→ auymle:都進去都是可以支援的
推 huggie:你這一串是真正有 ">" 開頭的 fasta 序列對吧?
推 huggie:試試看板友建議的轉文工具..先把他轉成另一種，再轉回來
→ huggie:搞不好這樣就整齊了..這樣最省事，再來就是自己寫程式
→ huggie:不過就像 auymle 說的，應該也無所謂吧?
推 tinin:能不能給你想要的output格式?這樣會比較清楚
推 nightcatman:http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/readseq/
→ nightcatman:各種格式都能轉
→ nightcatman:不過話說回來,這種東西應該隨便google都找得到吧...