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請問現在認知的人類基因數目個要從哪邊找? 我只查到這個...不過這是2004年的東西了 http://www.nature.com/nature/journal/v431/n7011/full/431915a.html -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.129.160.62
huggie:maybe http://tinyurl.com/3j5g9g 06/05 20:15
huggie:ensembl 是不是哪邊也找得到資料? 06/05 20:24
auymle:http://tinurl.us/31f3fd 06/05 20:53
auymle:但這些報導都focus在protein-coding genes 06/05 20:54
auymle:其實還有很多noncoding gene還沒被發現 06/05 20:55
huggie:原來 RNA 那些定義也算 genes? 06/05 21:09
huggie:我剛1F panther pie chart 那個是 reviewed refseq,選 all 06/05 21:09
huggie:數目是 25431 06/05 21:10
huggie:auymle這篇不錯...至少有個reference. =) 06/05 21:11
nightcatman:small RNA算基因啊 而且大部份都扮演調控的重要角色 06/05 21:12
huggie:了解 06/05 21:12
windincloud:夜貓大 照你這樣說 siRNA miRNA也是基因? 應該不是吧~ 06/05 21:40
windincloud:基因通常我們指的是functional gene吧 :P 06/05 21:41
auymle:miRNA當然也是gene 他們也有function 06/05 21:46
auymle:注意喔 siRNA指的是外生性的small RNA, 他不是生物體 06/05 21:48
auymle:自己產生的, 而是外來的 06/05 21:48
windincloud:哈 我了解我誤會在哪了~ 拍謝 我以為這邊要問的gene是 06/05 22:05
windincloud:model 所以才會說miRNA siRNA 非基因 XD 06/05 22:06
windincloud:^ gene model 少打 06/05 22:07
huggie:我知道miRNA有功能,但是我不曉得他們也定義為 "gene" 06/05 22:08
huggie:雖然常常聽到 "no-coding RNA" 06/05 22:09
Goldexp:現在已經發現endo-siRNA囉 06/05 22:29
Goldexp:會從transposon, long hairpin和cis-NAT region產生 06/05 22:30
huggie:endo-siRNA? 我一直以為 siRNA 跟 miRNA 結構一樣呢.. 06/05 22:53
Goldexp:endo-siRNA 是21nt miRNA長度就較不一定 06/05 23:22
auymle:應該不是這樣定義的吧?? 06/05 23:28
Goldexp:endo-siRNA會被hen1 modify miRNA沒這樣現象(in animal) 06/05 23:28
Goldexp:不是這樣定義沒錯 這只是從deep-sequencing觀察到的差別 06/05 23:30