Re: [詞語] synonymous substitution 和 synonymou …

[hgsfhevil (evil)]

※ 引述《huggie (huggie)》之銘言：
: ※ 引述《hgsfhevil (evil)》之銘言：
: : 這兩者在定義上有什麼不一樣嗎?
: : 我一直認為這兩個是一樣的
: : 可是看論文的感覺,又不像
: 最近有..很不願意的...在看一些 population genetics 的相關東西
: 要是講錯請包含。
: Mutation 是一個發生變異的那個 event。
: 在考量 within-species 與 between-species 的 context 之下，
: polymorphism 是 within-species、尚未達到 fixation 的一些變異，
: 也就是說有些 strain 是祖先的類型，有些是新的 mutation 所造成的類型。
: 這種情況這個就是 polymorphism。
: 如果是以經達到 fixation，就是所有的 strain 都是那種突變，
: 那就稱作 substitution。
也就是說,synonymous mutation是單一個DNA序列中,Base發生變異,例如:A->T
,但是不會影響protein序列的轉譯,但是經過長時間的演化,這個物種,都有這突變的事件,
則稱為synonymous substitution。

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◆ From: 140.138.155.220
推 huggie:對這是我的認知 但有聽說有的paper作者會弄混
推 nightcatman:看paper的領域吧,不是每個領域都需要分辨這兩個詞,
→ nightcatman:對某些領域來說,並不需要知道某個變異有沒有擴及整體,
→ nightcatman:也無法知道,所以自然就不會去分辨這兩個詞
推 huggie:對，這樣說也沒錯
→ huggie:意外發現晚貓人是Policy板板主 好板呀
推 nightcatman:多謝 :) 其實我只是幫忙代管而已
→ nightcatman:另外剛想到這種會混用的詞的例子還有 domain/motif
→ nightcatman:similarity/homology等等, 都是在某些情況下可以混用,
→ nightcatman:某些情況下則不能
推 auymle:similarity和homology不能混用 一個是可以quantitative
→ auymle:另一個卻不行
推 huggie:恩晚貓人我想知道什麼情況那些可以混用?
推 nightcatman:在沒有要特別強調序列是否有同源關係,而只是要表達兩
→ nightcatman:序列是否相似的情況下,就會混用,底下隨手找的連結有提
→ nightcatman:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=sef.
→ nightcatman:section.23
推 huggie:great!
→ hgsfhevil:很多名詞只根據上下文,可以混用,但是後續問題才是麻煩
→ hgsfhevil:歸納清楚,才不容易做錯