Re: [問題] 有沒有程式可以從distance matrix作tree

[starcloud (傷心嗎?)]

※ 引述《afra33 (豆豆)》之銘言：
: 現在手上已經有distance matrix了
: 不知道有沒有什麼程式可以從distance matrix
: 去做出phylogeny tree?
: 我試過phylip的 NEIGHBOR
: 不過...她的結果我覺得有點奇怪，
: (更重要的是他的output很醜....)
: 因為不常用phylip目前還不知道是什麼問題
: 想請問各位大大
: 除了neighbor之外還有沒有什麼程式可以做呢？

  MATLAB 是很好用的數學工具

  他有許多Cluster的方法

  你可以試試看用 hierarchical clustering

  來處理

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 140.114.214.30
→ lingon:不記得Matlab有tree display, phylip 網路板的parsing有
→ lingon:點問題, 可能你input的時候沒有parse好
推 afra33:Matlab...完全沒用過耶 有這麼容易上手嗎？
→ afra33:回一樓 我是已經拿到output結果 沒有error (當然是try很多
→ afra33:次以後....^^||) 只是我覺得結果有點醜
→ lingon:只是要畫圖的話, google一下網路上很多免費軟體
推 body:matlab bioinformatics有clustering，可以畫distance tree