作者hgsfhevil (evil)
看板BioMedInfo
標題[問題] 關於blast的用法
時間Wed Jul 2 21:52:47 2008
我知道blast是用來做序列比對的
但是有人知道blast可以用來"去除"序列相似度高的序列嗎?
我目前知道cd-hit可以這樣做
如果知道的話,可以先告訴我這指命嗎?
謝謝大家
ps:看來最近一堆人忙著趕論文,沒時間發問了
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 118.169.52.233
→ rebredoxin:你的問題應該是要reduce redundancy 吧!試試看這個 07/03 11:06
→ rebredoxin:網址吧! Good luck! 07/03 11:07
推 huggie:有啊..assembly的時候可以利用blast找到的序列做masking 07/03 11:43