[問題] 有關Ka/Ka ratio的問題 >"<

[hajimels (阿一)]

最近開始接觸comparative genomics
目前在玩Ka/ks ratio
試過PAML ( http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html#introduction )
搞了很久.. 搞不定
後來發現Bioperl也能做 自己coding完 還是有問題=.=
最後我選擇了這個 Selection ( http://selecton.tau.ac.il/overview.html )
不知道有沒有板友有類似經驗的呢?

我今天想做的是protein A
從低等到高等物種中 到幾是哪個物種X->物種Y 產了positive selection

希望大家討論一下囉~

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 ★ミ                                       ζ
                                         ○_.
                                        /(╯
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◆ From: 163.25.93.32
推 ZnU:我媽說原波是型男
→ hajimels:驚!@@ 幫我謝謝妳媽媽XDDD
推 realism:我最近也在弄ka/ks 用PAML 你有試過他的範例嗎
→ hajimels:我後來就只用selection來完成 範列我有試 倒是沒問題..
→ hajimels:但我確定格式沒問題 一換成我的seq就不行了 >"<
→ hajimels:不過我後來這部分暫停了 最近在分析1X片的array...