今天我利用Basic Folding Algorithm
http://bioinf.kvl.dk/~gorodkin/teach/bioinf2004/talk4_nov5.pdf
想找出一條seq.自我pair的狀況
但是今天我在trace back時會有非我要的配對出現
也就是原先我要AT、CG、GT這三種pair
但是出來的結果會有AA或CC CA這樣奇怪的配對出現
這樣的話 我應該如何處理?
有人有經驗嘛?
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ps. 由於我不須要知道是否有branch
所以我把branch判斷拿掉
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