作者hgsfhevil (evil)
看板BioMedInfo
標題Re: [程式] 關於R-cluster的input file 所接受的格式
時間Tue May 5 15:07:11 2009
我已經會使用R-cluster,請問大家,如何讓結果輸出
以下是我輸入的指令,
mydata <- read.table("test.matrix", header=T, sep="\t", row.names=1)
mydata <- na.omit(mydata)
mydata <- scale(mydata)
d <- dist(mydata, method = "euclidean")
myTree_avg <- hclust(d, method="average")
plclust(myTree_avg, hang = 0.1, unit = FALSE, level = FALSE , square = TRUE, labels = NULL, plot. = TRUE, axes = TRUE, frame.plot = FALSE, ann = TRUE, main = "", sub = NULL, ylab = "dissimilarity")
str(as.dendrogram(myTree_avg))<==只有在螢幕上秀出結果,但是我想要輸出在檔案
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◆ From: 140.138.155.193
→ angleevil:png("mygraph.png") 05/10 17:15
→ angleevil:plot(myTree_avg) 05/10 17:16
→ angleevil:dev.off() 05/10 17:16
→ angleevil:我後來才發現,原來我早就做好了,只是我用ssh連到server 05/10 17:17
→ angleevil:但是我沒有安裝x11,所以我一直看不到圖,= =真麻煩 05/10 17:17
→ huggie:從msg應該就可以看出來啦..XD 05/11 07:04
推 seebass:rdesktop是你的最佳選擇 =,= 05/12 23:28
→ hgsfhevil:R有windows版本,問題解決了,我當初那個是用ssh連到伺服 05/14 13:15
→ hgsfhevil:當然無法做出圖來,現在可以了 05/14 13:15