Re: [程式] 使用R cluster 處理microarray資料

[hgsfhevil (evil)]

http://www.wretch.cc/album/show.php?i=hgsfhevil&b=2&f=1516295336&p=0
我放在這裡面,不過他把我縮圖了
我主要是把中間那快移除掉,我只要是看他clust什麼
不是看那花花綠綠的東西
※ 引述《hgsfhevil (evil)》之銘言：
: ※ 引述《hermeslu (左慈)》之銘言：
: : 想問大家一個問題，
: : 我的狀況是資料比數太大，
: : 使用hclust，將資料as.dendrogram，再str看結果，
: : 可是資料太大即使捲軸在最高，
: : 分群結果還是無法從頭開始。
: : plot更慘，完全擠在一起，根本看不出結果。
: : 圖片
: : http://rbbs.biosino.org/Rbbs/posts/list/756.page
: : 想問版友：
: : 1. 有沒有指令可以將分群結果輸出成  .txt ？
: : 2. 或者其他分群package有包含可將分群結果輸出的指令？
: : 重點就是  我該如何得到分群結果。
: : 先謝謝大家，等待好消息
: 用Mev去繪圖
: 有人知道要怎麼把中間,一大區塊的彩色圖片移除掉嗎,
: 我主要是要看label(row,or gene)的分群
: 這樣的作法,根本看不到gene

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◆ From: 140.138.155.182
推 hajimels:你應該是有distanc matrices吧? 用R的hclust可以做你要的
→ hajimels:抱歉我突然看到你已經討論用hclust了...我目前只有想到R
→ hgsfhevil:其實我先用R hclust去做啦,而且我也有把圖片放大
→ hgsfhevil:我像素用2048*2028,如果用原來大小去看,字分的很開
→ hgsfhevil:但是用A4格式去印出來的字,還是擠在一起,這純粹是圖形
→ hgsfhevil:表示的問題,真的是無解