[討論] Next Generation Sequencing and Microarray

[hermeslu (左慈)]

  最近在看NGS (next generation sequencing) 的一些網站，
  其中一個中文網站認為
  NGS可以取代Microarray，
  這就是我不懂之處，
  Microaray 是幫助我們了解 gene expression
  在不同樣本間比較 (比如有病 VS 健康)
  NGS是分析genomic at sequence-base
  兩種方法對我而言目的不同，
  如何討論"取代"


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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 115.64.9.214
推 qqSmallFrog:People can use NGS to sequence cDNA or mRNA.
→ qqSmallFrog:By mapping the sequence reads to reference genome,
→ qqSmallFrog:we can directly count the number of reads from
→ qqSmallFrog:each gene. I personally prefer this over micro-
→ qqSmallFrog:array, which only compares the fluorescence,
→ qqSmallFrog:leaving rooms for error. (Although I haven't done
→ qqSmallFrog:either of them yet.)
推 wjho:如樓上 可以去查一些 RNA-seq 的 review paper 看看
推 leondemon:去思考一下NGS如何產生data 以及它的量和品質就可以知道
推 jademan:Nat Rev Microbiol. 2009 Apr;7(4):287-96. 參考一下
推 leftt:是可以取代，但是NGS價格實在太貴了...