[工具] NCBI可以查基因的註解嗎

[M5 (我很快)]

最近因為研究需要基因上的註解資料

譬如給定一個人類上的基因

那有辦法在NCBI上

查詢到這個基因Exon和Intron間的註解是哪些核甘酸嗎?




PS:

我目前只想到利用ClustalW

以此基因的序列當作reference sequence

來和此基因的mRNA作多重序列比對

不知道這樣得到的splice site會正確嗎??

--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 111.252.74.169
→ windincloud:記得沒錯~ 你先將此序列調出來後 可以看GenBank file
→ windincloud:這樣應該可以調的到 protein seq.
→ M5:但我要的是在EXON和INTRON間的DNA序列 用protein seq反推回DNA?
→ windincloud:ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/H_sapiens/mapview/
→ windincloud:試看看裡面有沒有gene model標註的gff檔然後再推出你
→ windincloud:要的intergenic data  (我先前以為你要protein seq.去
→ windincloud:反推~ XDD