[問題] 如何把全部 GEO 中某 GPL 的全樣本抓回?

[gsuper (Logit(odds))]

我需要抓 GPL10558 (illumina HumnaHT-12) 的全樣本

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL10558

內部有 3000 多片分散在 133 個 GSE 內

請問有沒有方法能直接下載

還是要靠各種 tricky 方式處理? (parser , wget .....0rz)

--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 140.113.239.247
推 hajimels:印象中沒有
→ hajimels:把GSEXXX從網頁pasre下來，然後用wget去fetch ftp比較快
→ hajimels:不過小心各實驗normalization的方法有所出入
推 stillcat:請問下載的檔名有沒有規律或是能知道,如果檔案名知道
→ stillcat:下載的 URL 都把他列出來, 把他放在一 HTML 檔案中,就可
→ stillcat:用軟體一次批次下載
→ gsuper:果然是跟我想的一樣要靠 parser + wget
→ gsuper:鬱悶
推 lingon:寫個perl script 去抓就好
推 huggie:R 的 GEOQuery 行嗎?