Re: [問題] 電腦模擬蛋白質製藥的需求?

[piimaila (肥仔)]

稍微整理一下目前討論結果

如果想要廠商接受
電腦實現高通量篩選要可行必須有
1. 配體(化合物, 藥物)夠多, 也就是目標應該定在 縮小傳統HT的範圍.
2. 由於目標是1 所以速度必須遠高於廠商能夠取得的HT機器之速度.
3. 由於是縮小傳統HT的範圍故價格要低於縮小HT範圍所得到的價格效益

但是, 如果另一方向想,
如果 能找到一個各方人才的團隊(主要是生技, 資訊人員)
開發出目前市面上疑難雜症的藥物, 該症目前可能宣稱為不治之症或慢性病
當然, 不可能是治癒, 但是理論上可以控制.

舉例說明: 紅斑性狼瘡, 第二型糖尿病, 痰湿型肥胖症

該藥物群"僅"通過電腦篩選. 這樣, 這些資料是否有市場呢?





※ 引述《s122s91 (lo)》之銘言：
: 如果你用現在上市的藥,
: 用電腦模擬去算,分數一定不是最高的
: 如果把電腦設定成"上市藥物"為最高分的參數,拿來跑,設計出來的藥物,活性通常不高
: 我想這就是困境。
: 不知道到現在為止,有沒有藥物是真的由模擬出來的。
: 電腦模擬就是模擬,不一定準。
: ※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言：
: : 想請問, 蛋白質製藥預測的整體解決方案
: : 例如:
: : 利用電腦軟體預估 以下課題
: : 多醣體抑制癌症能力(中研院)
: : 這種是否有實用性和市場?
: : 或市面上已經有類似廠商?
: : 當然, 這只是預測, 不可取代人體實驗 動物實驗等
: : 但可以大量的減少實驗範圍.
: : 弊人想投資類似公司, 但是由於才疏學淺
: : 故來此詢問各位先進和專家, 這類型的服務是否有前景呢?

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 172.245.16.16
推 puec2:我還沒看過沒有做過動物實驗的藥有藥廠會買的。
→ puec2:如果你們可以在不增加細胞或動物實驗的成本的前提之下，
→ puec2:利用modeling找出有效的小分子，這樣就有獲利的機會啦。
推 Marriott:但我覺得要想想,你要用的是套裝軟體,用的database也不外
→ Marriott:乎是MDL,NCI,SPEC等等常用的,你的target要有市場的話大
→ Marriott:概也不會是什麼冷門的標的,我是不覺得藥廠是完全沒作過
→ puec2:我倒不會這樣想，我預設他們有特殊的方法可以看到別人沒看過
→ puec2:的東西。但是如果只是買設備和軟體回來想做modeling代工...
→ puec2:或許對一些國內的小藥廠甚至大學裡面需要多一個DATA用來增加
→ puec2:paper內容的實驗室會比較有吸引力。
→ puec2:做一次modeling收個5萬，給出10幾種compound讓研究生去try
→ puec2:只要看到效果就好，micromole級的EC50也不在乎 XD
推 motorbird:Amgen一個計畫他們的computing candidate有上千個  真的
→ puec2:*micromolar
→ motorbird:到了in vivo可能再narrow down到30個  為什麼有這種差異
→ motorbird:就是因為無法預測毒性  安定性  溶解度等等的問題
→ motorbird:如果你們的系統準確率很高  連這些都可以做預測
→ motorbird:那價值才有辦法做出來  不然花大錢組個團隊後面效益可能
→ motorbird:不高  需要好好考慮...
推 Marriott:PK,ADMET等等的問題太多了,真能找到一個lead還真是難阿
推 puec2:溶解度有的時候是要看是誰在做 XD
推 motorbird:只是其一嘛 XD 模擬跟實際在目前來說差異還是很大
→ puec2:http://www.kubinyi.de/vs.pdf
→ puec2:給您參考
→ piimaila:基本上毒性 溶解度等等倒不是問題~雖然不太好說
→ piimaila:但是 基本上能出來的資料除了驗證效果外. 無毒, 可吸收
→ piimaila:倒是可以保證
→ piimaila:當然啦, 我指的是普通人不是問題, 病人就...不太確定
→ piimaila:簡單的說, 就是利用傳統食品內純化的東西下去做預測
→ piimaila:並簡單的計算劑量和藥物預測這樣
→ piimaila:當然啦, 我是搞電腦的, 其他的東西我不太懂@@
→ piimaila:我這裡只是處理高速運算. 生技問題我不太想讓我的合夥人
→ piimaila:知道我在非常猶豫(當然他不上ptt 不看中文..所以才來這問
→ piimaila:)^^~~
→ puec2:其實你如果可以提供他們的paper 大家就可以告訴你他是有
→ puec2:獨門技術還是靠套裝軟體砸出來的
→ piimaila:我去問問...
→ skyyo:上次聽有人講所謂生技創投金主就是3F Friend Family Fool
→ skyyo:建議當做買bit幣差不多 買了就放著 放著就忘了吧
→ piimaila:bit幣~漲翻了大哥
→ piimaila:我有陣子也在玩 小賺一點, 但現在摸都不能摸
→ piimaila:還有 事實上我投入不太多, 只是改程式和架設高速Server
→ piimaila:出一點k20而已 bit幣時代殘存的雜物 拿來用用這樣
→ piimaila:而且 我是覺得他們的東西 基本上可行 可行的原因
→ piimaila:是根本不是新藥 只是新應用而已
→ piimaila:簡單的說 治療一些奇怪病症的藥 根本早就有
→ piimaila:只是沒人拿來治療那些病症 當然 我只說電腦預測可以
→ piimaila:實際上是未知的...
推 skyyo:我是說請把這次投資當作跟bit幣同等風險的等級
→ skyyo:bit幣是有漲沒錯 但不代表同等風險的都一定會成功