Re: [問題] 電腦模擬蛋白質製藥的需求?

[piimaila (肥仔)]

※ 引述《ljii (是否)》之銘言：
: ※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言：
: HTS說穿了就很多很多種藥物然後讓機器人幫你作投藥跟收data的動作罷了,

所以廠商基本上是亂槍打鳥? 還是預先知道藥物範圍?

: 直接拿一百萬個藥去作HTS, 有100個well裡的細胞死掉了

這樣費用大概多少, 我參考一下興大的費用
1 X 96 （每次篩選一個樣品）： 新台幣 9,800 元

這樣是說 一次一個蛋白質樣品, 測試96種化合物
是不是這樣呢? 當然 做多是有優惠, 但是一次拿100萬個事不是成本非常高?
那實務上又如何縮小範圍?

: 所以"僅"通過電腦篩選的都還需要進行大量的細胞和動物試驗
: 距離實際可用的資料還有很長的距離
: 以這種低期望值的資料來說, 商業價值可能不會很高

恩, 這樣 用電腦預測和用HTS的預測差在哪裡呢?
是否通過HTS預測的就不需要細胞和動物實驗?
如果 HTS一樣得通過細胞和動物實驗 這樣為啥要選擇HTS不選擇電腦篩選?
兩者之間的差距差在哪裡呢?

恩, 補問一個, 所謂的市場價值不是很高是大概一個可能性多少錢呢?
是否有交易成功的案子可以參考?.?


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◆ From: 172.245.16.16
※ 編輯: piimaila        來自: 172.245.16.16        (11/22 16:52)
推 HOHO0220:電腦預測好發paper阿 換個參數 target就一篇
推 HOHO0220:電腦模擬的價值在學術上面比較大
→ piimaila:是一堆會結合拉, 如果無腦亂黏的話, 問題是價值何在?
→ piimaila:感覺上我乾脆找教授賣超級電腦比較好賺orz
→ piimaila:跟他們說, 喵的, 妳們買那70萬的是搞笑, 我賣妳只要半價
→ piimaila:然後賺3倍這樣 XD (我說的是真實案例, 不過他不是買70萬)
推 puec2:其實說真的，這才是比較好的商業企劃。因為現在國科會要求
→ puec2:應用性，HTS又不是像PCR machine一樣人人有。如果你們可以
→ puec2:降低設備門檻然後順便代理個軟體，應該很多單位會買單。
→ puec2:因為只要用你們的系統預測一些compound出來，就可以扯說
→ puec2:自己的研究很有應用性，有找到有潛力成為新藥的compound..
→ piimaila:基本上軟體到處都找的到, 只是要針對機器特化而已
→ piimaila:代理的軟體用的是通用機台, 速度根本上不去
→ piimaila:簡單的說, 就有點像是拿萬能刀去做手牌小刀的事
→ piimaila:不但貴上許多, 也做不好
推 puec2:如果可以做到軟體綁硬體那就更好了。
→ captdavince:最廣的HTS當然是什麼都篩亂槍打鳥..但是經費、時間、
→ captdavince:人力有限，當然會限縮一定的範圍
推 rickson:對大藥廠來說，篩個藥花個一百萬美金都不算貴
→ rickson:給你算半天 他寧願花錢解決
→ rickson:不要拿台灣國科會預算這種等級的錢 套用在這些大藥廠上
→ piimaila:基本上, 如果以10000/day來說, 目前我手頭上是2.4萬/day
→ piimaila:不會慢慢算...只是, 目前我學習了一下, 似乎和HTS是相輔
→ piimaila:相成, 傳統HTS許多做不到要靠電腦篩選, 而電腦篩選對
→ piimaila:濃度等控制也做不到, 要靠HTS
→ piimaila:oh~我補充一下 2.4萬/day是單機的運算, 沒上cluster
→ piimaila:10組就可以加個9~10倍沒啥問題
→ piimaila:當然 尚在學習中~感覺上是可做 但是問題不在速度
→ piimaila:在沛體受體資料庫是否準確 才是最大的盲點