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我的實驗是做Wnt pathway 簡單的說~就是想辦法讓Wnt pathway on or off 然後去看他的下游gene的expression 目前為止~activate Wnt pathway都沒有問題 有問題的是inhibit 我使用的材料是dnTCF TCF是Wnt pathway下游的一個transcription repressor 這個construct是跟別的實驗室要的 問題來了 在test的時候就發現我的dnTCF不work 於是就做了transfection跑western看他protein有沒有表現 跟wild type比較的結果 western幾乎沒有表現~(意思就是wtTCF表現很多) 這當中老師懷疑是我transfection的問題 於是我co-transfect了GFP當作internal control 在照相的時候發現GFP的亮度有變 老師又懷疑是我照相的問題 於是我心一橫 又做了一次co-transfection with GFP 分別拿去跑flow和做IF 發現其實transfection efficiency都差不多 可是在wtTCF和dnTCF中 GFP的螢光減弱很多(無論是flow或是IF都是這樣的結果) 而在IF的結果中 dnTCF幾乎沒有表現 所以問題有幾個 1.到底為什麼我的dnTCF不會表現?? 我要到的construct是delete掉N-terminal 93個amino acid 而我查paper一般用的dnTCF的construct是delete N-terminal 31或33個amino acid 但是我去查了TCF的 structure 即使delete掉前面93個amino acid應該是不會影響他的function才對 所以我一直不知道為什麼我的dnTCF不表現 2.在wtTCF中看到GFP的螢光亮度減弱是可以理解的 因為TCF是transcription repressor 有可能因此抑制了GFP的表現 重點就在於~這個現象在dnTCF裡面也有看到! 如果dnTCF不會表現,它怎麼去影響GFP的expression?? (我有做另一個control是transfect plasmid 的backbone但沒有任何gene 發現GFP的expression很亮~所以wtTCF和dnTCF相較之下變弱很多) 請版上高手幫忙解答吧 我已經搞這個搞了很久 弄得很挫折 希望大家可以一起討論~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.109.4.195
shaline:建議你先確定作western時用的anti-TCF Ab的epitope是否 03/21 13:59
shaline:落在N端delection的位置;再者,dnTCF可能有表現,或許有 03/21 14:01
shaline:function,但也會造成wtTCF dominant negative,導致TCF 03/21 14:04
shaline:在western中無法被detect到。 03/21 14:05