※ 引述《bluecarol.bbs@micro.bio.ncue.edu.tw (休息..走更長遠的路)》之銘言：
: 1.mismatch repair
: 2.nucleotide excision repair
: 請問這兩種修補作用是什麼呢?
一般的分子生物課本
跟網路都可以找到
http://asajj.roswellpark.org/huberman/DNA_Repair/ner.html
DNA修復系統主要有下列幾種：
Base-excision repair
Mismatch repair
Nucleotide-excision repair
Double strand DNA break repair
Error-prone repair(SOS response)
錯配修復 (Mismatch Repair)
Mismatch repair修正在DNA複製時產生的錯誤，
舉例來說，可能是一個C誤與A配對，或者是polymerase跳過或重複一些base，
造成1~5個unpaired bases。參與的主要酵素有：MutH、MutL、MutS
MutH：會去辨識GATC sequence並接在此處。
MutL：連接MutH和MutS的蛋白，形成一complex。
MutS：辨識突變的nucleotides並與其相接。
SSB：會保護ss DNA(single strand DNA)。
藉由MutH-MutS complex，DNA會被拉近形成了DNA loop，
MutH帶有一個site-specific endonuclease，直到碰到hemimethylated GATC sequence
才會被活化。GATC endonuclease將unmethylated strand上的GATC中G的5'上切下一刀
(nick)，表示說這一個strand是要被repair的。
用DNA helicase II由3'到5'把DNA打開(unwind)，然後exonuclease I
將出錯的這一股DNA從GATC的地方吃掉nucleotides一直吃到突變的部位。
(註：如果突變的部分位於兩個GATC中間，上述nick和吃掉nucleotide的動作
也可以從有GATC的兩端進行。)最後再用DNA polymerase III和DNA
ligase把空缺補起來。(註： 有時錯誤配對的地方離GATC segment 相當遠，
甚至到1000個nucleotide以上，要耗費相當多的能量來完成1個
nucleotide mismatch的repair。MutH會認識新舊股DNA，
在新股GATC中G的5'上做Nick，這個步驟很重要，
因為新舊股不能認錯是做repair的先決條件。
移除nucleotide的exonuclease activity是
在polymerase III上3'到5'exonuclease activity。)
核切除修復(Nucleotide-excision repair「以E.coli為例」)
先用ABC excinuclease在DNA lesion(即發生錯誤的部分)的左右各切下數個
nucleotides(切下的數目因物種和損壞的base數目而異，
在E. coli共切掉12~13個nucleotides)再經過DNA helicase後，
含有damaged base(s)的DNA離去。
DNA polymerase I把缺少的nucleotides補上。
DNA ligase把nick補上。
跟Base excision-repair不同的是nucleotide excision-repair是
拿走一段oligonucleotide而非單一個BaseꄊAABC excinuclease可以切下錯誤部分的兩邊，然後整段拿走，
因為DNA polymer只涉及十幾個nucleotide的合成，
所以只要用DNA polymerase I而不需要用到DNA polymerase III，
最後當然要用DNA ligase把gate封起來。
（取自http://life.nctu.edu.tw/~mb/c30302.htm）
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※Post by snark from nat-11.tpc.edu.tw