※ 引述《lakerjackt.bbs@ptt.cc (NN )》之銘言:
> 請問有人知道如何找到house mouse的app gene的promoter
> 我ncbi網站翻遍就是指看到mRNA和gene,完全沒有promoter的sequence
> 所以請各位高手幫幫忙!!
> 謝謝!
> ----------------
> 不然告訴我怎麼找promoter也行,但不是找人類的!
找paper應該是唯一出路了
promoter region只能理論預測,必須要實驗證實才比較可信
找文獻中最常用的region最保險
若真的都找不到,就自己clone自己試試看囉
要clone的話,要找到transcription initiating site
(參照有人做過的RACE data應該找得到)
初始設計的primer最好能夾出從-1.5k~~+200bp區域
長一點較好,再慢慢narrow down出專一區域
挺麻煩的,但不做也不行啦
若一開始clone太小段的話,很容易miss掉一些重要區域且不夠客觀
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