由於小弟剛從network biology相關範疇轉到evolution這一方面相關研究
目前現行比較常用的evolutionary rate之計算方法似乎是dS/dN的計算
而這方面也有套件paml可以使用 dS/dN的計算需要align好的DNA or RNA sequence
但由於小弟手中只有amino acid sequence而不是nucleotide sequence
想請教一下板上曾經或是正在做相關研究的大大
有沒有哪一種理論是只利用amino acid sequence就能測出evolutionary rate的方法?
希望能給一些提點或是關鍵字串好讓我去搜尋
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