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※ 引述《ericsson (每個人都是貴人)》之銘言: : 【問題】: 關於生化路徑的迷思 : 【問題起因】: 生化路徑通常可以分為: : 代謝反應; 訊號傳遞; 基因調控等 : 目前不才正在研究的範圍侷限於代謝環境之模擬, : 問題來了!~ 老闆突然問了一個問題, : "關於訊號傳遞及基因調控網路", 可以視為等同代謝網路嗎? : 【個人看法】: : 對於這個問題因為所看的paper不夠廣,所以目前還未找到答案, : 但若就任何反應可以如 A + B ---> C + D : 那麼, 這個的問題是否就是可以當作一種代謝反應的進行? : 謝謝各位~~ 恩... 其實你的問題 可說是相當複雜耶 這個問題的探討除了橫向metabolic pathway 真正隱含的是 genomics->transcriptomics->proteomics->metabolomics 的縱向關係 其實現在雖然會分說如protein-protein interaction等不同層面的networks 但在生物體上偏偏都是很多層面的networks一起調控 形成同時包含縱向和橫向的關係 而你老闆所問的問題 我覺得像是跨層次的問題 不能說就是"等同" 但卻又是關係重大 很難明確的做出一個定義 而你說的A+B--->C+D要當作代謝的進行 當以metabolomics networks時 可以這樣看 不過我想...metabolomics是最複雜的了... 必定得往上個層次回推 把network的觀念放寬至不同層次 我想會比較好拉 只不過... 光genomics->transcriptomics->proteomics 這條路的整合問題就多了...>_< 代謝我接觸較少 都是玩上述3個層次的關係較多 個人淺見 參考看看就好^^"" -- ★ミ ζ _. /(╯ 【今晚的天空有一顆流星劃過 在預言著什麼】|> -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 163.25.93.32