※ 引述《snark (影燕)》之銘言：
: ※ 引述《pooldodo (破渡渡)》之銘言：
: : E. coli O157 552 kb
: E. coli 是 4,639,221bp
如果你是說 E. coli K-12 的話是 4,639,675bp 差不多
但是我標的是 O157:H7，它的 genome size 是 5,528,445bp
Science. 1997 Sep 5, 277(5331):1453-74
Nature. 2001 Jan 25, 409(6819):529-33
: 其實要做過就會知道
: 研究上的困難是在
: 真菌是二倍體 酵母菌還好
: 但是如果你研究白色念珠菌就慘了
: 2倍體 要研究基因 或是 PCR
: 都會受到有兩個拷貝的影響
: 另外白色念珠菌沒有質體
: 最後是電穿孔
: 因為先行系統多是對於 E coli 還有 酵母菌研發
: 所以條件不太適合其他真菌
這裡提到的問題應該是做一些基因轉殖上的研究
例如做 mutant 或是送 plasmid 會遇到的問題吧
雖然我不確定原 po 指的研究 genome 是指什麼 XD
: 另外抗生素基因也是很麻煩 真菌是真核生物
: 所以抗真菌的抗生素對人類可能有害
: 管制比較嚴格
我就定序上會遇到的問題回答吧
已定序上會遇到的第一個問題就是錢吧
做了Shotgun Library 可能花個五六萬
用 library 做 sequence 1Mb 少說也是兩百多萬
如果用 GS FLX ，一個 run 六七十萬，但是要準確也不可能只做一個 run
如果是細菌的話，可能連大大小小的 plasmid 用 GS FLX 一次就蠻準了
如果是真菌可能就要兩倍以上
smaple 製備又是另外的問題了
當然除非你要研究的對象已經具有 whole genome sequence
不然真菌已經被全部 sequence 的種類當然遠比細菌來的少
就 genome 上面的複雜度，真核生物更是遠比原核生物來的複雜許多
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