Re: [問題] 我想請問有關alternative splicing

[MrCAKE (Keep Working)]

※ 引述《boblu (六百)》之銘言：
: 抽 mRNA 跑 northern, 同一個 probe 會染到多條不同分子量的 band
: 抽 mRNA 跑 RT-PCR, 同一組 primer 會跑出不同大小的產物
: in situ 要怎麼看啊？一時想不出來說
in situ 我也不知怎麼看

第三個方法可以用RNase protection assay

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 219.81.144.101
※ 編輯: MrCAKE          來自: 219.81.144.101       (08/08 22:35)
推 guyspy:in situ比較像事後confirm用 先知道spliced region之後
→ guyspy:再設計會hyb到那段的probe。這段probe就會黏不上去
→ guyspy:但是在表現full-length的細胞中卻可以有訊號
→ guyspy:另外你還需要一組probe會黏到full-length和spliced form
→ guyspy:都存在的region 來證明你的目標細胞有表現這個gene
→ guyspy:其實還有一個生資的方法~~利用EST去預測可能的splicing
→ guyspy:RT-PCR之外也可以搭配5'RACE以及3'RACE一口氣解決