Re: [問題] 偽基因

[aeroufo (神手~~)]

※ 引述《PlanktonEvil (邪惡皮老闆)》之銘言：
: ※ 引述《linyi781227 (paul)》之銘言：
: : 【問題】：偽基因為什麼可以留在細胞裡面?
: : 【問題起因】：小弟在看科學人的時候讀到偽基因,裡面說偽基因可能在以前是一些有功
: :               能的基因複本,因為遭受破壞而沒有功能.既然沒有功能為何沒有被淘汰呢
: :               ?為什麼仍然能隱藏於基因組裡面呢?
: : 【個人看法】：
: : 【參考資料/連結】：
: : 請大家幫忙解惑~謝謝^^
: pansci前陣子一篇文章，大約3%左右的DNA是合成蛋白質，
: 大約80%左右都是負責決定什麼時候合成什麼蛋白質，
: 剩下約有10%左右則是沒有明確功能。
: 不過這還是不能說明"為什麼"就是了...
: 如果上帝是一個程式設計師，那他大概很喜歡複製程式來用，所以do的指令只用了3%，
: 有80%都是在寫if，然後10%可能是註解，或是隨時可以拿來小改一下程式...  :D


如果你是專業寫程式的，我用這樣的講法來解釋你可能就可以理解為何在生物的基因

裡，大部分是所謂的偽基因，目前知道的基因鹼基是由ATCG四種所組成的，生物演化

最主要的理論中，關於基因的序列，並未有一個最原始的模板(也就是所謂的上帝)，

所以到底這些基因是如何組起來的，你就把它當作大樂透好了，雖然只有四個鹼基，

但是中獎的號碼長度不等(轉譯蛋白質的序列)，隨機取樣，請問你的中獎率會有多高

??而要怎樣的買家才能夠在演化中活下來??就是你要中獎好幾次並且保留這些序列的

買家才會留下來(存活)，可是你大部分沒有中獎的序列仍會被保留(目前稱偽基因)，

所以能夠有3%的中獎率是不是很高呢??但是在科學家不斷的研究下，也發現那些沒法

轉譯出蛋白的序列仍有很多是有生物意義的，所以真正有生物功能的基因有多少還是

未知數，所以如果你用寫程式來比喻基因的演化是比較不恰當的，最原始的基因模板

，以目前最主流理論來說應該屬於隨機取樣，當然這個隨機取樣還要考慮鹼基彼此的

親和力不同。


P.S 這是非常簡單化的比喻，因為最原始的模板比較可能是單股RNA而非DNA

P.S 2 如果你要用有原始模板，然後才開始進行演化的想法，那就是另一種說法外星

      生物說，地球的生命是由一顆隕石帶來的，或地球是外星人的試驗場(好玄壓)

最後抱歉因為在上班沒法太詳細解釋^^，還有科學不是不能假設的，只是要合理的假設

所以說我最後才會說如果你認為是像上帝寫程式，那就是比較傾向外星生物論，而目前

許多的研究越來越印證這些鹼基是可以在原始地球環境下自行形成有功能的序列。

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    .     .    無敵冷笑話   .  .  .  .  靠怎麼那麼多冰雹
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 163.25.93.8
推 mythos:為什麼你會認為那些沒中獎的序列真的會被保留下來呢？
→ mythos:這世界競爭這麼激烈，若有細胞能把沒用的東西突變丟掉，
→ mythos:自然能把那些保著老舊無用訊息的細胞競爭淘汰掉。
→ mythos:而雖然一開始沒有膜板，但隨著病毒等載體的出現，
→ mythos:不同生物的基因序列間確實是存在著抄來抄去現象的。
→ mythos:建議你可以再看一些新一點外文大學程度的生物學，
→ mythos:以及較近期的研究文獻。
→ mythos:就算是要一起消遣 [智慧創造論]，也是需要多些新資訊的。
推 mythos:若你對我第一句回覆有疑問，且你手邊有養E. Coli的資源
→ mythos:可試試看：無抗生素逆境時，帶有抗抗生素基因的細胞所占
→ mythos:          比例對時間的變化情形。
→ mythos:結果應該會讓你很驚奇－原來不是只有鬼島競爭激烈而已。
推 ZnU:樓上的大大好激昂呀~雖然我是創造論支持者,可是我覺得你舉的例
推 ZnU:不是很貼切,抗抗生素基因應該是位於plasmid而不是chromosome上
→ ZnU:吧~就算是好了,這段基因的size對細菌的genome size比例是遠超
→ ZnU:過其與human genome的比例,故一定會有較大的stress而將他排除
→ ZnU:總之我相信這些看似無用的序列總有一天會被找到功能,然後謝謝
→ ZnU:原坡上次幫我壓腳,不愧是抽筋達人科科^.<
推 mythos:前天在公司受了些悶氣，有點牽怒了，先跟原PO說聲抱歉 Orz
→ mythos:抗抗生素基因可以在plasmid上也可以在chromosome上
→ mythos:在plasmid上的，逆境一消失通常都會丟超快
→ mythos:在chromosome上的只要菌種有recA等基因 (野生品系通常都有)
→ mythos:配合幾次再接種操作，其實也是可以在幾天之內就看到變化。
→ mythos:而抗抗生素基因通常也幾 kbp 而已，其實所占比例不算太高。
→ aeroufo:事實上我不認為基因體序列一定要有用，有時是維持穩定壓
→ aeroufo:還有別擔心，科學討論就算有爭論只要在闡述理據不要人身攻
→ aeroufo:擊都是OK的啦^^我很隨和的~~