→ limiya:謝謝你寶貴的意見 我一定會參考^^ 11/07 11:58
※ 引述《limiya (陳小咩)》之銘言：
: 我想請問
: 我利用一個軟體叫做Beacon_designer設計primer
: 然後跑出一推primer candidate後再去blastn看是否這個primer會和其他的sequence
: 我的問題是
: 通常拿去blast的小片段primer sequence會blast到一堆其他的gene sequence
: 我blast了許久都找不到專一gene的primer
: 請問有人可以提供你們在設計primer上的經驗或是方法嗎?
: 謝謝~
提供一點小小的經驗給您參考
其實Blast出來的片段雖然很相似
但是可以看看〝完全一樣〞或是3'端相似的比例有多少
如果3'端一樣的比例很少，那麼設計出來的primer有時候還是可以使用的
另外，也許你可以去看一下那些完全一樣的序列
有時候不會以基因的名字表示
而是以當初做定序的clone編號命名
其實代表的是同一段基因
給您做個參考
如果有錯，也請大家指正，謝謝！
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我不想在球場上當一個沒用的人
也許我真得不是很厲害
再練下去也只有這樣子...
可是.......我就是會認真地去練習
賭賭看明天會不會變強一點...
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