[問題] 請問是否有可以了解INTRON的網站

[mandible (生化...go go go !!)]

請問是否有可以了解自己設計的primer是否有跨過INTRON的網站
例如說
輸入自己的PRIMER之後就會顯示你設計的PRIMER位於何處?

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 203.64.49.5
推 oxoox:你自己設計的primer不是照著序列找的嗎 怎會不清楚位置呢
→ oxoox:怎麼可能會不知道有沒有跨intron呢 不太懂你的問題
推 transmore:可能他是從cDNA設計..但不知道exon的接合處...
→ transmore:如果是RT-PCR就沒關係了..從genome去PCR就有差
推 aggaci:這很簡單，找cDNA和genomic DNA 序列對一下就知道了
推 mandible:3F說的隊.我當然是從cDNA去夾阿.
→ mandible:想請問要如何知道此gene的genomic DNAㄋ
推 oxoox:有一個網站很好用http://www.ensembl.org/index.html
→ oxoox:這應該是做分生人的必備 要好好研究一下
推 aggaci:如何知道?!當然是從NCBI找阿
推 mandible:J我想我說的不好.大家都不太了解我的意思
→ mandible:我的意思是.我鍵入primer後就可以直接告訴我位於哪個exon
→ mandible:如果是從Cdna去釣.很複雜!不好意思讓大家誤會~
推 gilchang:blast in UCSC genome Bioinfo, or blast in Ensembl