作者KECCO (畢業V.S失業)
看板Biotech
標題Re: [問題] 請問質譜儀如何訂出蛋白質序列?
時間Sat Apr 28 21:50:19 2007
※ 引述《untilnow (炸～豬排)》之銘言：
: ※ 引述《mason (錯愕...渺小...)》之銘言：
: : 請問質譜儀如MS/MS, 如 ESI-Q-TOF 是怎嚜訂出蛋白質序列的@@?
: : 可以解釋ㄧ下嗎?
: : 先在應該沒有人在用sanger method 了吧@@>?
: : 謝謝^^
好比說 一個protein MW=5000
經過質譜能量的提供會將a.a. 打斷
而可以看到 斷一個aa.的分子量 譬如說4911 打斷兩個變成4778
所以會在質譜圖上看到 斷不同數量的a.a.後的分子量訊號
在將兩根訊號相扣得到單一個的a.a的序列
以上述的例子就是 (5000-4911=89, Ala), (4911-4778=133, Asp)
這樣拼拼湊起結果~
有了解到吧~~!!所以 可以得到protein seq.
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 220.139.45.168
推 mason:有點類似Edman Degradation,但質譜的斷法好像是片段化@@>? 04/29 13:40
推 untilnow:MW 5000 會再使用TRYPSIN等酵素切成小塊 04/29 17:05
推 tonbushai:是利用Data base 來比對已知質譜圖嗎?? 05/01 00:58
推 untilnow:應該說,利用不止一種酵素分別切成小段，來確任每一小段 05/01 11:03
→ untilnow:的蛋白質序列，及每小段的排列方式 （因為不是每個點 05/01 11:04
→ untilnow:的斷裂機率都一樣） 05/01 11:04
→ untilnow:對己知蛋白，trypsinize後的PATTEN可以向DATABASE比對 05/01 11:05
→ untilnow:但未知蛋白也可以使用它來定序 05/01 11:06