作者bluecsky (我要藍藍淡淡的天空)
看板Biotech
標題Re: [問題] TOPO cloning
時間Wed Jan 23 08:15:07 2008
※ 引述《ad1980 (Apoptosis)》之銘言:
: 之前有問過 TOPO 的問題,
: 現在又有了,想問問看有沒有人知道。
: 就是阿... 我把 pcr 接到 Topo vecter 上之後,
: transform 到 E. coli 裡。
: 但是呢... 隔天出來的 colonies 幾乎都是 template vector...
: 明明就只有用一點點做 pcr, 接的時候也只拿 pcr product 的 2ul/50ul,
: template 的量應該是少得可憐,
: 可是 transformation 出來,存活的 colonies 都是 template。
: (很不幸我的 template 跟 Topo vector 一樣都是 Kan resistent)
: 我 labmate 的問題也是一樣,
: 最後他的解決辦法就是把要 pcr 片段從 template vector 切下來,
: 再用那個片段去 pcr 才解決這個問題,
: 可是這樣很麻煩,難道每次用 Topo 都要這樣嗎?
: 有沒有人遇過同樣的問題,或是知道為什麼會出現這種情形。
: 為什麼 bacteria 那麼喜歡 template vector,
: or 那麼討厭 topo vector?
: 感謝。
這問題很好解決...多一點點步驟而已
你就把PCR product拿去跑gel 再切gel上的band來純化
就可以做好了..當然你要先切下再跑PCR也一樣
雖然麻煩但是沒辦法..因為這種vector轉入的效率本來就比較好
加上如果你用的是一整套TOPO kit..裡面附的comptent cell效率又更高
至於為啥更愛這vector?..原因很多阿..可能你TOPO vector比他大
比較小的vector會比較好轉..又或者是你TOPO接的效率不夠高
by the way..這種純的vector大多只要用不到0.1 ul就可以轉出一大堆了..
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◆ From: 59.112.214.105
推 shunze:那為何不用另一種抗生素篩選?我記得TOPO有兩個 01/23 09:49
→ bluecsky:我用的TOPO是有amp跟kan這兩種.. 01/23 11:56
推 ad1980:我 labmate 試過拿 pcr 去 gel extract,結果一樣,所以 01/23 11:58
→ ad1980:她才試把片斷先切下來,主要是要讓 temlate 沒辦法存活 01/23 11:59
→ ad1980:我們實驗室用的只有 kan 而以... 01/23 12:01
→ ad1980:可是我之前用 pGEM-T system 都沒有這種情形耶... 01/23 12:04
→ ad1980:我的 template 比較大,快 8kb... 01/23 12:04
→ ad1980:我們是用一整套的,不是少少幾顆,就是很多但都是 template 01/23 12:05
→ ad1980:才想說 Topo 跟其他比起來那麼不受 cell 歡迎阿?? 01/23 12:07
推 MrCAKE:在原本template上的抗生素基因中間切一刀如何 01/23 13:03
推 ad1980:to 樓上:對厚... i will try it tomorrow~ 01/24 09:40