推 realrex:請問MatInspector是線上搜尋,還是要安裝軟體呢? 10/15 16:23
最近在cloning幾個基因的promoter
也要對其上可能具有的transcription factor binding site做預測
我使用的線上軟體有TESS,TFSEARCH,以及PROMO (這是爬文找到的)
但是我將序列輸進去之後,得到的結果我卻不會分析了.
使用TESS分析之後,找到的可能結合位有一大堆,但是他給的許多數據我卻看不懂
(有去網頁上看過,但是對於其定義還是不了解)
使用TFSEARCH,可以自己設定"score"
雖然網頁上有給score的算法,但是我不懂他的意思
score = 100.0 * ('weighted sum' - min) / (max - min)
什麼叫做weighted sum,又min,max代表什麼
以及大家設定score時,會設最低的score值為何呢?
另外promo...也是會得到非常多的可能TF binding site
請問有人可以敎我到底要怎麼分析所得到的結果
真的是萬分感謝了~
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 122.121.180.136