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請問一下~ 關於Real-time PCR測得的copy number數 因為 我做的樣品濃度都很低 當copy number太低時 會導致Ct值都會約38-39才上升 而且 這時候都會三重複都有點誤差 之前有問過前人 她跟我說即使是做standard curve 也沒辦法做到這麼低的copy number 量太低時也都會"飄"掉(三重複有誤差) 所以 想請問一下 若我遇到這種情況 我應該就直接把Ct值大於38的直接忽略掉 當作沒測到嗎?@@ 可是 這樣也蠻奇怪的 因為我的Health是不會上升 若把Ct值大於37忽略掉 這樣感覺上有點怪 但若硬要說它有 卻得到的數據沒有那麼準確 (因為連standard curve最後也都不太準了) 請問 有人有好的建議或參考資料可以看嗎? 謝謝^^ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 61.62.92.63
willieh:第一,你的樣品有稀釋嗎?若有記得別稀釋太多倍。 10/12 23:46
willieh:第二,試著將std cuv往後拉,若在37,38還有線性,就OK! 10/12 23:47
sinlu:有稀釋 可是我還是把量設定在ABI跟我講的範圍內 10/13 00:23
sinlu:因為 他們跟我說 template量太多 有時候反而會影響結果 10/13 00:24
sinlu:所以 我就沒有改濃度 10/13 00:24
sinlu:嗯嗯 我目前也是將standard curve往後啦 盡量測多點 10/13 00:25
sinlu:所以 standard curve最多也只能測到Ct 37-38左右嗎 10/13 00:26
sinlu:謝謝^^ 10/13 00:27
huangsw:有用melting curve看過嗎 38 39有的時候是非特異性 要小心 10/13 00:36
willieh:不過你目前是template不足,增加template量應該沒問題 10/13 00:59
willieh:若是擔心n-spc binding,檢查Mt就會知道了(primer決定...) 10/13 01:02
willieh:我也試過加倍primer(0.5uM→1uM),有時會有幫助..抱歉縮寫 10/13 01:05
sinlu:我做的是TAGMAN 抱歉 忘了說 10/13 01:32
willieh:啊...那抱歉了,我的是SYBR G的經驗.... 10/13 01:42
sinlu:沒關係@@ 還是謝謝你 10/13 02:12
candy315:通常Ct值要控制在15~30內,會被認為數據比較可信喔 10/14 22:18
candy315:當然如果你CT38也在standard curve的線性上,應該也OK啦 10/14 22:19
sneak: 我做的是TAGMAN https://noxiv.com 11/11 01:03
sneak: 謝謝^^ http://yofuk.com 01/03 16:46