[討論] RAPD的polymerase選擇

[koodoozoo (直到累倒才認輸)]

我們實驗室是用F牌的taq polymerase

昨天我要做第二次的check的時候，發現舊的用完了，冰箱也沒庫存了

我只好換了一個不同的taq polymerase來用

結果~~~除了最明顯的條帶是相同的，其他都不ㄧ樣

而我要找的差異條帶也不見了~Q Q

我自己覺得雖然都是taq polymerase，但PCR產物的量差很多

其中一個號稱效果比較好的dream taq簡直就是亮到刺眼的程度

而且產物都集中在2000 ~3000bp

請問各位大大，taq polymerase對RAPD的再現性有這麼大的影響嗎


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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 140.120.240.148
→ sGoat:光是PCR用不同家的Taq都會有很大差異了...
推 fc01:有PAPER講過,RAPD就算條件和操作者一模一樣,再現性大約只有
→ fc01:86.6%,其他RFLP,microsatellite,AFLP都是100%左右
→ fc01:而且,RAPD超過2000bp的條帶基本上不可信,沒什麼再現性
推 dankai:每家的Taq跑出來的條帶都不ㄧ樣~~像我用Takara的條帶集中在
→ dankai:2000多~~~如果用便宜一點的super-therm就會出現在1000上下
→ dankai:再現性說真的不高~我今天作換給學弟作後...結果可能就不ㄧ
→ dankai:樣了~~~ 變因超多!!@@ 我們老闆拿著過去學姐做的一直叫我們
→ dankai:學妹做出ㄧ模ㄧ樣的...唉!!! 原PO你如果選定ㄧ個taq就固定
→ dankai:不然RAPD以他再現性而言...會玩死你!!!
→ koodoozoo:謝謝大家的回答~~感恩
→ sneak: 光是PCR用不同家的T https://noxiv.com
→ sneak: 不然RAPD以他再現性 https://noxiv.com