作者Locutus (電影狂)
看板Biotech
標題[求救] 做完ligation發現有contaminte到其他東西
時間Sun Nov 23 18:21:25 2008
我目前做construct碰到一個問題,我挑的幾個colony用restriction enzyme切都可以切下
和insert大小,我就把這幾個送去sequencing,我用的是T7 primer,從vector讀進去,可
是做sequecing的技術員說我送的sample有兩個template,的確sequence的圖有些是有兩個
peak,我就用這幾個clone做PCR,可以P出我要的大小,再把PCR product送去sequencing
,又都是我要的東西,因此我懷疑我ligation的時候有contaminte到其他東西,我又把這
幾個clone重新transform嘗試把contamination分離,我再送這些我認為去掉contaminate
的clone去sequencing,結果還是有兩個template,可見我還是沒把他們分開,我想問一下
有人有這樣的經驗嗎,我該怎麼把他們分開。
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 219.84.236.37
※ 編輯: Locutus 來自: 219.84.236.37 (11/23 18:28)
推 blence:建議你可以換個primer,vector可能有2個T7,或2個類似的site 11/23 18:54
→ Locutus:根據data sheet這個vector只有一個T7,不過我不知道有沒有 11/23 20:01
→ Locutus:類似的site,我會換個primer,不過我比較傾向是污染 11/23 20:02
推 micocat:plasmid 稀釋10倍或100倍再去transform呢 11/24 15:42
→ micocat:有二個 template可能是e coli帶有二種plasmid 11/24 15:43
→ micocat:稀釋plasmid之後 再用colony PCR check看看 11/24 15:44