推 oplz:thanks so much, I'm trying it~ 04/19 00:17
※ 引述《oplz (Go Patriots! Go Brady!)》之銘言：
: ※ [本文轉錄自 BioMedInfo 看板]
: 作者: oplz (Go Patriots! Go Brady!) 看板: BioMedInfo
: 標題: 不同 isoform 表現的問題
: 時間: Fri Apr 17 07:12:44 2009
: 一個可能是很基礎的問題
: 現在正在研究的基因有三種 isoform, 皆存在 NCBI 的資料中.
: 三者的差異在 alternative splicing on the last exon.
: 請問如果想知道三種不同 isoform 在身體各種不同細胞或組織的表現情況
: 該如何做?
: 找出不同 isoform mRNA 紀錄的 tissue source 可能是一個辦法
: 但我剛試了一下 NCBI 弄不太出來..
: 不知有否能人異士對這問題可以相幫? 多謝!
要看在不同組織的表現情況的話 比較可能的做法是看EST
到UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/)
先點genomes 搜尋到你研究的基因 點進去
然後到網頁下方mRNA and EST tracks
選擇你要看的EST database 把display 從hide改成full 然後按旁邊的refresh
這樣應該就可以看到所有的EST
點任一個EST會出現相關資訊 例如組織來源
這是只要看少數的基因的情況
如果想看很多基因的話 要到下載區下載EST資料 然後用程式去抓到你要的資訊
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