[求救] Cell fraction assay by triton-x100

[mikis1107 (mikis1107)]

爬文後發現有人也類似問題
但是我的問題比較複雜一點
(可能對於有做過這方面實驗的版友來說很簡單><)

讀到的paper將細胞分成好幾的部分來看

pellet-->CSK buffer(含0.1%triton)萃取-->離心後得到S1 sample

剩下的pellet2-->CSK buffer wash-->離心後得到W sample

pellet3+DNase作用-->離心得到Ch sample

pellet4+CSK(含0.5%NaCl+0.1%triton)-->離心後上清液S2 sample
                                     下方p sample

一共分成五種sample

我的認知是:
1. S1 是cytosol中的蛋白?
2. W  是當control的wash buffer確保裡面沒有蛋白質?
3. Ch 應該是Chromatin part?
4. S2 是否為nuclear protein?
5. P  是否為細胞骨架蛋白?

paper是有解釋一點點
但是我想問的是為什麼可以這樣分
每種溶劑是利用甚麼原理把蛋白分開的??

從沒做過這方面實驗所以有點疑問
可以請有做過的人幫我回答一下嗎?
感謝感謝><

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 114.41.181.135
推 chvkimo:附上paper連結 其他人會比較容易回答(這些buffer我都沒看)
推 chvkimo:查了一下CSK buffer = cytoskeletal buffer
→ chvkimo:其他還是請高人指點吧!!
推 ranilla:我覺得很難解釋，detergent的用法除了百分比外
→ ranilla:還包括操作時的溫度，高或等或低張，細胞總數有關
→ ranilla:如果你實驗室有pierce的目錄的話，可以看看前面
→ ranilla:protein extraction的部分，寫的還蠻不錯的
推 ranilla:所以一樓是對的