推 bigcat24:BLASTN 若用錯資料庫 就會找不到哩 01/15 18:04
→ wt1seven:database選others 若不選是內建比human的 01/15 22:13
→ Asialin:我原本就是選others，用的db是nt/nr 01/15 22:16
→ ssbin:d/b換成HTGS試試看呢? 01/22 18:07
我是用PCR的方法來偵測是否有Tricomonas的感染
每次檢測都有一些sample無法判斷究竟是否陽性
它們都是single band，亮度正常，但較預期大小稍大一些
我把其中幾個的PCR產物純化之後送定序後做alignment
確定這些來自不同sample的PCR產物序列都相同
再將此序列用NCBI做blast (大小為482bp，不算太大)
結果卻是No significant similarity found....
不同批實驗、不同個sample，做出來都是相同序列
所以我覺得序列本身應該沒有問題
但為什麼無法找到相符的資料？
希望板上有blast達人可以解決我的問題
或者告訴我除了NCBI之外，還有沒有別的資料庫可以用
感謝 > <
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