作者blueashin (tRoMboNe pLaYer)
看板Biotech
標題[求救] AT-rich PCR 無產物
時間Tue Jan 19 18:45:55 2010
想請問各位高手
我要擴增一段DNA片段
前提是這組primer用於擴增該基因的cDNA是沒有問題的
但是不知道為什麼 用來擴增DNA的時候 卻怎麼放都放不出來
於是我分段來擴增這個基因
沒想到分成兩段來擴增 居然可以擴增出來
問題來了 我試圖把兩段用RE切斷然後接在一起
再進行全長DNA擴增
沒想到 依然失敗
後來把兩段分別定序 確定是該基因沒錯
也發現它的AT content大概是70%
google了一下發現大家都用降低extesion溫度 以及拉長extension時間來擴增這樣的片段
於是我做了extesion temperature的gradient pcr
發現在extesion temperature=56時 有我要的產物
但我想再重複
卻又不見了
QQ
實在很苦惱 不知道有沒有人遇過這樣的事情
感恩~
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 210.241.123.131
→ puec2:Google: Betaine DMSO 01/19 21:49
→ blueashin:恩...我想 這兩樣是高GC比的時後在用的吧? 01/19 22:08
推 singren:條件多試一下吧~總有做出來的時候XD" 01/20 12:16
→ blueashin:~.~"謝謝你的鼓勵~ 01/20 23:13
→ bobbygau:最近也是在做一段AT-rich基因的擴增,一直P不出來,直到 01/21 23:59
→ bobbygau:試了瑞林生技代理的KAPA HIFI,超讚,他們有試用品。 01/22 00:02
→ blueashin:喔喔 請問 南部有代理商嗎? 01/23 00:40
→ blueashin:我目前用的是clontech advantage2已經是很敏感的酵素了 01/23 00:42
→ blueashin:不過當然有時候過於敏感的酵素會有反效果 01/23 00:42
→ blueashin:謝謝你提供的資訊 我會試試看^^ 01/23 00:42