→ soom:PCR可加biotin-dUTP來做Labeling 02/03 13:38
→ aggaci:這我當然知道，只是用那麼長的probe作EMSA我實在不知道這 02/03 15:12
→ aggaci:CHIP差在哪？ 頂多CHIP是看整個promoter的差別而已 02/03 15:13
→ aggaci:再說畢竟biotin-dUTP不=dTTP 會不會影響結合也不知道... 02/03 15:16
※ 引述《deliciosa (I HOPE...)》之銘言：
: 請教大家一個有關EMSA的問題。
: 因為現在我必須要在動物組織中證明，某一個transcription factor(CREB)
: 與BDNF promoter有結合。所以想使用EMSA證明 (Panomics)。
: 但在詢問產品專員的結果是還要另外請人合成一段biotin-labled
: BDNF promoter ds sequence。
: 那這樣不就等於 只是證明CREB與BDNF promoter有(無)結合；但並非用來證實
: 在我的實驗condition之下，CREB 的確有(無)與BDNF promoter結合。
ㄜ...我看不懂這兩句話有什麼差別
: 所以現在是不是必須要自己設計primer，然後將tissue中的BNDF promoter sequece
: 放大並lable上biotin。
: 麻煩各位幫我解答，謝謝！
若不需要知道確切的結合位置
其實用CHIP就夠了
用PCR放大？我沒看過有人做EMSA的probe是用PCR放大的ㄝ
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