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各位好,我現在在化學實驗室工作,沒有分生專長的學長姐可以問 所以想請大家幫忙 我現在想在一個7k bp的E.coli vector中插入一段約60 bp的序列 大概是長這樣 ----T7 promotor-----intein---target protein----- ↑ 插在這裡 intein是作為affinity column純化時使用,約50kD的protein 原本的MCS在intein的下游,但在插入target protein時已經用掉 那麼我該怎麼把60 bp插到promotor和intein的中間呢? 目前想到的大概是 用Site-directed mutagenesis在想插入60 bp的地方, 先插入兩種restriction site,約12或15 bp,再用ligase接上去。 不過不曉得Site-directed mutagenesis有沒有辦法直接插入60 bp呢? 另外,我們手頭上其實沒有這60 bp的DNA,應該要怎麼製作出來呢? 我猜大概可以先請別人合成60 bp的RNA,再用RT-PCR作出DNA...這樣做可行嗎? 原PO非專家,兩個簡單問題請教大家 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 123.195.2.120
DJHINN:直接和成 DNA就好了 = = 03/31 14:21
DJHINN:60bp PCR做不出來 RT也有點浪費 且我也懷疑做不出來 03/31 14:22
DJHINN:找 和成引子的 公司 跟她說 你要合成 一段 60bp的引子 03/31 14:22
DJHINN:拿到之後 做a-tailing的實驗 在頭尾 +A 03/31 14:23
DJHINN:方便你insert進 VECTOR 03/31 14:23
DJHINN:另外 你的vector是自備的嗎? 還是 商業的 03/31 14:24
DJHINN:看起來應該是自備的,60bp : 6000 bP我覺得不好塞 這方面 03/31 14:25
DJHINN:可能要嘗試多次一點 03/31 14:25
DJHINN:你用限制酶切下來的片段,可能要用到3%左右的膠跑看看 03/31 14:26
DJHINN:關於 insert部分 我好像有點弄錯了 因為我把它當成一般 03/31 14:37
DJHINN:commercial 的 TA clone vector了 那部分 ....就算了吧 03/31 14:37