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作者sancra (Lab Pub Orz...)
看板Biotech
標題[求救] gene expression database
時間Tue Jul 20 23:18:37 2010
我想請問有沒有database 是可以查gene在各個cell line裡的expression情形 我通常都會上UCSC去找資料 不過那裡只能找到在normal tissue的expression array 所以想問一下有沒有別的database 是有整理各個gene在各個現存的cell line裡的expression profile 煩請指教，謝謝 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 122.121.205.216
推 spirithorse:其實我看不太懂,但是NCBI有個OMIM(在右邊的選項) 07/21 00:20
→ spirithorse:填入gene後可以看到大概的研究方向還有reference 07/21 00:21
→ sancra:喔，我的意思是有個target gene想要knock down 07/21 08:35
→ sancra:但我不太確定要在哪一株cell line做knock down 07/21 08:35
→ sancra:其實應該做個western看看哪株cell line有表現我要knock 07/21 08:36
→ sancra:down的gene，但我們lab太多cell line了....所以我想說不知 07/21 08:36
→ sancra:能不能先找個database看看，就不用這麼麻煩了 07/21 08:37
→ ordinary07:biogps http://biogps.gnf.org/#goto=welcome 07/21 08:44
推 hwjuranus:樓上的網站也大部分是normal tissue 07/21 09:33
→ hwjuranus:cancer cell-line的話 很少看到有提供expression的 07/21 09:34
→ hwjuranus:我們自己是有分析的cell-line expression 07/21 09:35
推 aceliang:用nci的database？ 07/21 16:59
→ rimeni:biogps有cancer cell line的expression profile 07/22 12:10