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第一次在這邊發文 如果格式有問題的請不吝指教 今天抽RNA時(用REZOL)因為我的細胞量少,大約只有8*10^5,所以REZOL加了大約100ul 接著加入約20ul的chloroform靜置後離心取上清液 接著加isopropanol靜置半小時以上,THEN 離心去上清液 在所有sample中某一管的純度A260/A280只有1.53左右,其他大約都在1.7附近 現在不知道RNA純度1.5左右可不可以繼續做RT 請各位不吝提供經驗指教,謝謝~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 111.250.13.90 ※ 編輯: starjim 來自: 111.250.13.90 (06/05 22:35)
shenhsu:我們實驗室是以跑膠看到shape band為能夠繼續做RT的標準 06/06 00:25
shenhsu:RNA純度應該是>2.0 所以你的sample可能有DNA或protein殘留 06/06 00:26
shenhsu:不過如果之前1.7左右都OK 那只要RNA quality好應該就OK 06/06 00:28
kakaman:還是可以做 06/06 01:04
vancent:一搬rtpcr其實沒差 06/06 01:10
starjim:想請問純度會影響到後面轉cDNA和PCR後的跑膠嗎? 06/06 01:10
starjim:那純度是會影響後續哪個部分? 06/06 01:11
kakaman:你可以試試看阿 我以前1.5左右還是照用... 06/06 01:12
sackler:usehot acid phenol extraction again 06/06 11:23
birdddd:1.7以下我就不用了耶 可能有雜質 06/06 16:03
starjim:那請問我如果做再次純化的話會比較好嗎? 06/07 00:03
FUJI0904:其實我覺得用這種抽法的話,因為細胞量少而減少REzol的 06/11 14:36
FUJI0904:使用量並不會比較好抽,因為如果你用的是一般的1.5 ml 06/11 14:37
FUJI0904:微量離心管,最後上清液會非常「薄」,很容易取到中間介 06/11 14:38
FUJI0904:面層,就會容易吸到DNA或protein。 06/11 14:39
FUJI0904:我建議如果下次還要做,還是用1 ml的REzol + 200 ul的 06/11 14:40
FUJI0904:氯仿,畢竟至少200 ul的上清液其實相對較好吸取 06/11 14:41
FUJI0904:而且比較可以不怕吸到中間層,不用擔心細胞太少的問題 06/11 14:42
FUJI0904:RNA的濃度決定在你最後的回溶,而不是一開始REzol加的量 06/11 14:42
starjim:我有加過比較多量的REZOL~可是離完心後上清液變的不透明 06/12 15:20
starjim:會有點粉紅色的REZOL的顏色 06/12 15:20
FUJI0904:要不要試著離久一點,我抽100萬顆還是用1c.c.也沒啥問題 06/15 11:17