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今天跑PI時,如往常般的處理細胞(70%酒精 over night)及染色, 以往在DMSO control皆會有G1.S.G2/M明顯的peak,但今天要在重複實驗時, 卻在FL2A-counts圖只出現一個山丘狀的圖形也很不sharp,完全沒有其他的Peak產生 而在FSC/SSC圖細胞也不是均勻散布,反而有點橢圓形緻密,然後在FL2-A/FL2-W 也沒出現正常的圖形,反而是一條長長的細胞帶狀圖,調了很多次數值也一樣, 叫出以前同樣細胞同樣處理的condition也是找不出問題 想請教版上的專家,有在跑PI時碰過類似的情況嗎? 細胞的處理:藥物處理 24 48 72小時 Control:DMSO 細胞打下來前都有先觀察,和先前的實驗差不多,這是reapeat實驗 先謝謝大家的幫忙了 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 122.117.13.40 ※ 編輯: gqqueen 來自: 122.117.13.40 (02/28 02:20)
FireHell:參數跑掉了 02/28 02:34
gqqueen:可以請F大再詳細說明嗎 不懂參數跑掉指哪一個? 02/28 02:45
FireHell:FSC, SSC, FL2, FL2-A, FL2-W這些參數的Voltage和amp 02/29 13:06
FireHell:要調一下 02/29 13:06
FireHell:另外橢圓形和帶狀都是正常的耶 02/29 13:08
qiet:flow cytometry有受過什麼調整過嗎? 02/29 19:31
qiet:有的話參數要重抓 但如果機器都正常...可能要想別的原因 02/29 19:32
gqqueen:隔天我有先拿別株細胞測試是不是reagent出問題,跑完之後 02/29 22:17
gqqueen:都是對的,所以我馬上拿我有問題的sample從新跑一遍, 02/29 22:17
gqqueen:最後發現出現peak怪怪的只有在48.72小時,而24小時的都很 02/29 22:18
gqqueen:正常,所以目前把問題縮小到48,72小時細胞前處理哪個環節 02/29 22:19
gqqueen:但原因現在還不清楚,我唯一想的到的可能,是細胞收下來後 02/29 22:20
gqqueen:放在室溫一個小時,不知道是不是這樣的因素 導致MDA-MB-23 02/29 22:21
gqqueen:細胞出問題,才會跑出奇怪的圖形,不知道大家覺得這樣 02/29 22:22
gqqueen:的解釋合理嗎?這是排除人為操作,reagent,flow熟練度 02/29 22:22
gqqueen:唯一的可能解釋了,因為這個實驗我repeat兩次都沒問題 02/29 22:23
gqqueen:就在最後一次出了問題了@@" 02/29 22:24
qiet:細胞收下來後固定前我都會放在冰上or4度C 避免細胞產生奇怪的 03/01 01:14
qiet:變化 03/01 01:15
lyu0001:可能是同一批細胞固定染色不完全 03/01 10:25
FireHell:不同時間點的FSC和SSC可以參數不同,GATING範圍不同 03/01 14:15
FireHell:看起來比較像是細胞型態在48H後劇烈變化而沒有GATING好 03/01 14:16
FireHell:另外一個可能就是你的TREAT會導致S phase arrest 03/01 14:17
gqqueen:給Qiet 我48.72小時細胞收下來後,就擺在架子上,大約一小 03/01 20:08
gqqueen:時以上= = 當時後再做另一個實驗,所以就沒先處理了,下次 03/01 20:08
gqqueen:我會先放在冰上看看 03/01 20:09
gqqueen:給F大我跑PI只有gateingFL2-A/FL2-W這邊,然後我發現48小 03/01 20:10
gqqueen:時候的細胞,在FSC/SSC這邊有幾管出現疑似兩群不同大小的 03/01 20:12
gqqueen:的細胞,但他們還是有重疊,形狀類似於兔子的耳朵但有交疊 03/01 20:12
gqqueen:不知道這樣形容貼不貼切 03/01 20:13
gqqueen:48小時以後的細胞 03/01 20:13
gqqueen:給L大我細胞都固定至少24小時,然後染色也有兩個小時以上 03/01 20:14
gqqueen:避光保存,這樣還會發生染色固定不完全嗎? 03/01 20:15
FireHell:收細胞要快,所以放1h絕對不ok,不過會不會導致這些結果 03/02 15:12
FireHell:不得而知,建議下次收細胞要連續之外,可參照這篇 03/02 15:12
FireHell:http://0rz.tw/wAduL 03/02 15:13
FireHell:另外注意流速控制在LOW SPEED 100 EVENTS/SEC 03/02 15:15
gqqueen:謝謝F大提供這個很棒的資料,可以把參數條得更好,非常謝 03/02 22:18
gqqueen:謝你,這次重做我不敢再放那麼久了,本來以為不會出什麼 03/02 22:18
gqqueen:什麼問題,看來下次收下來前一定要先放冰上,盡快固定 03/02 22:19
※ 編輯: gqqueen 來自: 122.117.13.40 (03/02 22:19) ※ 編輯: gqqueen 來自: 122.117.13.40 (03/02 22:20)