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大家好,最近我在中研院訂了兩株基因的shRNA菌液 (為pLKO.1 vector) 自己用TB養大量抽取以後,老師教我先試試看直接transient transfect至293細胞中 目的是想確認這兩組shRNA是否真的在細胞中有作用 奇怪的是完全都沒有knock down 在這之前我都確認了 1. shRNA已定序過,的確是辨認我想要的基因 2. 大量DNA用phenol/chloroform沉澱過,有跑膠且測定OD260/280為1.6-1.7 3. 抗體已確認過可用,我曾經外加表現此基因至293細胞,major band有增加的現象 4. 我確認自己trasfection的技術沒問題,還請其他人幫忙做過,也無 K.D.的反應 我在中研院訂這兩組shRNA時,它還有feedback表示兩組的K.D.效率都有70% 不知道版上有沒有人曾經拿過中研院的shRNA轉染到細胞有K.D.成功的,想請教心得 感謝~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 125.232.26.135
TAKONA:沒有selection嗎? 02/28 21:48
begrace:沒有耶,因為只是暫時性表現而已 02/28 21:49
icome:transient transfection效果都很差 做成病毒才真正有效果 02/28 22:20
icome:不知道為啥 中研院這系統很tricky 02/28 22:21
icome:篩成stable會有效 但會比病毒感染差 02/28 22:23
icome:還有feedback只能參考 自己做常常都不會到那個效率... 02/28 22:25
begrace:謝謝樓上! 02/28 23:25
begrace:我再試試看其他組,或著直接做lenti virus試試 02/28 23:25
liuse:它每個gene應該都有至少五組plasmid 02/29 02:49
liuse:建議全部買來試 02/29 02:50
liuse:另外用lentivirus效果真的才會好 不然就用puro篩吧 02/29 02:51
dragonjaff:transient transfection +puro 細胞會死一大票 02/29 03:20
dragonjaff:等篩成stable又要一段時間 建議你還是直接包lentivirus 02/29 03:21
dragonjaff:原po的狀況跟我一樣 相信我 不要試了 直接包病毒最快 02/29 03:23
liuse:不用篩stable阿 把存活的收下來壓western就好了 02/29 04:42
Realthugz:transient效果難拿捏 KD效果每個clone都有差 02/29 20:03
begrace:今天跟老師討論,他提到實驗室之前也有人訂過中研院的 02/29 23:06
begrace:shRNA,並強調之前的人有用transient的方法做成功過.... 02/29 23:09
begrace:謝謝各位的意見,我會再試試 02/29 23:13
blood321:我是用Nucleofector 去轉染 effiency還頗高! 03/01 09:50
puec2:嘖嘖 還有人在跟中研院的shRNA奮戰 03/01 12:52
puec2:用RNAi比較快啦 03/01 12:52
sancra:transient要注意protein half life的問題(之前被陰很久) 03/01 20:45
begrace:@@ 樓上上是指中研院的shRNA不好做嘛? 另外protein half 03/01 21:40
begrace:life是指要先確認這個蛋白質在細胞內會表現多久嘛? 03/01 21:41
sancra:因為shRNA是degrade mRNA,所以新的protein不會做出來 03/02 09:17
sancra:但舊的protein還會在,那舊的protein要多久會自然被degrade 03/02 09:18
sancra:掉,你可能要查一下,因為transient進去的shRNA效用也不久 03/02 09:19
leoblack:樓上good point!!! 03/02 14:31
Realthugz:就是sancra說的那樣 才會做virus比較好... 03/02 15:38
Realthugz:transient的window其實可以很小 被你觀察到是賺到... 03/02 15:40
begrace:瞭解,謝謝大家給的資訊:) 03/02 22:40
puec2:如果不是需要stable clone, siRNA比較快啦。真的。 03/07 15:11