作者suhow (單身一輩子..)
看板Biotech
標題[求救] imageJ 計算細胞數
時間Mon Mar 26 16:10:44 2012
發問時請注意,若是要問實驗相關的問題,請將實驗的步驟、所用的條件大致列出
以方便板友幫您追蹤問題
----請將上列注意事項以 ctrl + k 刪除後開始編輯文章----
最近再做Hoechst染細胞核,看apoptosis
本實驗室的方法是用相機ramdom拍九張相片
用肉眼判斷apoptosis cells除以toatal cell
因為數量實在太大,想使用imageJ來計算total cell number
請問imageJ可以批次處理相片嗎,還是一次只能處理ㄧ張相片
因為每次都還要重設條件實在太麻煩,
至於計算出來的結果我絕得沒有很準確
像有些細胞aggregate再ㄧ起,他就判斷不大出來
條件要怎嚜設定呢??謝謝大家。
--
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 210.60.122.10
※ 編輯: suhow 來自: 210.60.122.10 (03/26 16:11)
推 FireHell:這程式本來就很不準ˊˋ 03/27 03:21
→ mzac1b:個人經驗: 螢光強度一致的話 同一批相片就用同條件計算 03/27 05:49
→ mzac1b:imagej 其中有 watershed 這個選項可以區分黏住的細胞 03/27 05:51
→ mzac1b:其實一般文獻都只有簡述 "用imagej" 計算而已 03/27 05:52
→ mzac1b:條件設定會很主觀 但至少要有 正 負 control供參考 03/27 05:53