作者hotayu (給我畢業,其餘免談)
看板Biotech
標題[求救] 請問有關在NCBI中GEO裡的GSE ARRAY DATA
時間Sat Jun 2 23:08:41 2012
各位先進好:
最近我在paper上發現一篇文章,其中作者利用在NCBI的GEO databse中的一個GSE array
data 來分析他門感興趣基因是否有在臨床的sample有表現。只是因為GSE的data是連續70
片array的資料,顧我想請問是否這些不同片的data以戶心normalize過了,因為我寫信給
作者,作者他們回答是直接使用GSE裡的數據直接做統計計算,並無再用array分析軟體
將所有data normalize。
請問各位真的是不需再normalize了嗎?
謝謝
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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 114.42.102.42
→ soom:通常series matrix file裡的資料是有normalized過的 06/02 23:46
→ soom:也可注意seris file的Sample_data_processings裡的說明 06/02 23:47
→ hwjuranus:如果是給TXT檔 那就是作者上傳已normalized的結果 06/04 11:16
→ hotayu:謝謝各位說明,那我只要直接截取裡面數據即可以了 06/04 12:11