Re: [討論] 病理切片IHC要怎麼看懂?

[wjtseng (final)]

我有做過一些IHC的染色和分析
我的經驗是這樣
細胞核藍色是Hematoxylin
細胞核棕色是染了p65使用DAB
計算比例的方式文章會有說
我的猜測是選定region of interest
數ROI內有多少個藍色的細胞核 negative
數ROI內有多少個棕色的細胞核 positive
然後 positive rate=棕色#/(藍色#+棕色#)
另外這邊的統計是使用box plot
中間的那一條線是Q2 Second quantile 是 median 不是mean
box plot 最上面那一端是max
box上面那端是Q3 Third quantile 也就是 75th percentile
box下面那端視Q1 First quantile 也就是 25th percentile
box plat 最下面那一端是min
會使用box plot可以看出這組數據是否有左偏或是右偏, 數據分布,
有時也可以看出是否可能有outlier
至於顯著的部份有可能是使用one-way ANOVA 也有可能是t-test


※ 引述《apiali89293 ( )》之銘言：
: ※ 引述《spirithorse (咩)》之銘言：
: : 因為最近Paper越來越多有病人檢體的切片IHC
: : 但是沒做過,所以也不知道該怎麼解讀
: : 有些地方藍色(我想應該是nuclear);但是紅色有深有淺
: : 請問是否有達人可以稍微講解呢?
: : 範例: http://ppt.cc/Msk8
: : 附帶一提...能否順便講解右邊的bar圖要怎麼看??
: : 感謝!
: 我的碩論是病理相關，有一些IHC的DATA
: 圖B的縱座標有寫是染p65在細胞核內的表現  如何計算比例在文章內應有詳述
: 藍色的部分是細胞核沒錯，不過不是重點
: 重點是棕色的，因為細胞核染上p65會呈現棕色
: 這個實驗主要是看p65在三種腫瘤組織中的表現(Tn、Tm、Lm)
: 很明顯可以看到Tm和Lm中p65表現比較多，經統計分析後可能發現有顯著差異
: 作者可能會解釋說p65表現比較多可能和腫瘤的invasiveness有關
: 以上是我個人理解，歡迎指正

--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 128.175.195.94
→ a001ou:想請教一下 要如何避免挑選region的發生呢 每次染完IHC
→ a001ou:總會發現大片組織會有些DAB較深 有些較淺 這真的很令人困擾
→ wjtseng:其實應該是要看你染色的組織和想要看怎樣的結果..我的樣品
→ wjtseng:染色後多半會選ROI..只有少數狀況是全數..至於DAB深淺的
→ wjtseng:問題..這個就要在染色的時候注意了..或是之前process影響