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我要看的蛋白大小約14kDa,但不知道為啥就是一直壓不到 (抗體確定ok) 試了好多方法,也換過membrane材質,就是一直壓不出來 (連一點背景都沒有!完全空白!) 所以想上來請教大家,請大家能給我一些意見!!拜託~ 我的transfer buffer配方 25 mM Tris, 192 mM glycine, 0.1% SDS, 20% methanol 沒有調pH值,配完直接用 semi-dry跟濕式兩種都試過 濕式 400mA或300mA, 一小時 semi-dry 0.8mA/cm2, 一小時或15V, 45分鐘 (這條件是爬文過參考其他板友的建議) membrane無論是NC還是PVDF也都試過 (兩種用的都是0.22的) 以上條件通通壓不出來 (崩潰 T.T) 我曾試著把sample拿給我同學,請他幫我做WB (抗體也是我給他的) 結果他用濕式400mA, 一小時 竟然可以壓出來!!!!! (徹底崩潰~~) 我跟他只差二抗不同,transfer buffer配方也是一模一樣 後來我還跟他要了一點二抗 (因為想說會不會是我的二抗壞了) 其他條件完全照他的,結果還是一樣崩潰!!!!!!!!! 大概壓了不下十次以上了吧~始終找不到optimal的條件 真的不知道是哪裡出了問題 想請問大家,無論是濕式或是semi-dry,我用的條件是OK的嗎? 可是其他人都能壓到<20kDa的,為什麼我都壓不到 T.T 抗體出問題? 可是請我同學幫忙,結果也OK 本身細胞表現量不高? 可是我上q-PCR,Ct值幾乎跟GAPDH一樣 實在想不出來還有什麼地方有問題了 還是要再提高methanol的濃度呢? 可以請有經驗的大家救救我吧~那是我的target protein,一直壓不出來真是生不如死阿~ 麻煩大家了 (鞠躬~) -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 114.24.70.217
alaric:你確定proteins transfer 到membrane了? 08/26 01:14
alaric:懷疑, 您是不是把電接反了? 08/26 01:15
alaric:先檢查SDS-PAGE是否跑好, 再檢查是否轉過去membrane? 08/26 01:16
回alaric大,我可以很確定電極沒有接反耶,因為同一片membrane,GAPDH都壓得出來 SDS-PAGE跑的時候看起來也沒什麼異狀,所以應該不是電極接反的問題
martyrtitan:SDS-free Meth提高到30%試試 08/26 01:29
謝謝martyrtitan大的建議,我再試試看~
im9527tw:幾%的SDS-PAGE? 08/26 01:33
10%跟12%的SDS-PAGE都試過了
robinduck:q-pcr是RNA的表現,時間點應該比protein早不少 08/26 02:12
robinduck:另外transfer完拿膠去染coomassie blue看有沒有你的band 08/26 02:14
我也有染過coomassie blue了,如果是semi-dry, 55kDa以下的幾乎都不在gel上了 這樣的話應該也代表我的蛋白也跟著過去membrane了吧?
blence:不要再改條件了,直接去同學的實驗室跟著做一遍比較實在 08/26 04:42
wadeedaw:也許根本不是轉的問題 這種半乾條件一定都會過去阿 08/26 07:37
恩~理論上來說確實這樣的條件應該都會過去,但我想說是不是已經過頭了~ 因為壓出來的片子是清清如水,連一點背景都沒有 ※ 編輯: nk12914 來自: 114.24.70.217 (08/26 10:09)
martyrtitan:墊兩層就知道啦 08/26 11:52
回m大,其實也試過墊兩層,marker 11kDa確實會跑到第二張mambrane,但還是壓不到蛋白
icome:你有染ponceau S確認嗎... 08/26 12:13
有耶,blocking前都會先染,確實在26kDa以下的部分比較染不太到 ※ 編輯: nk12914 來自: 114.24.72.212 (08/26 16:00)
aeeaee1128:膜改用GE這牌,transfer時間縮半(有過即可,不用全過) 08/27 00:30
solomo:底片空白?顯影劑失效?呈色劑失效? 08/28 00:12
joseph103331:跟著做一次比較保險 直接用眼睛看比較準 08/28 00:33
joseph103331:很多的細部差異用口述很難告知 08/28 00:34
spirithorse:淚推...我懂版大的苦!!! 08/28 02:02
Anvec:實驗做不出來 有很多很多因素 有時候是不被發覺的地方 08/28 07:38
Anvec:比如電源供應器的穩定性 建議你直接去你同學的實驗室做一次 08/28 07:38
Anvec:排除是操作問題後 再一個一個試 比如借 buffer 借器材 08/28 07:40
Anvec:pH 值有時候也會影響 如果 pH meter 不準的話 08/28 07:41
formosana:我之前也有壓過14KD的,不要跑太久速度要調慢,不然會跳海 08/31 14:53
formosana:不建議用Semi-dry 常常都轉不過去 08/31 14:55
formosana:濕式我有時候會讓他overnight或4小時以上喔!!! 08/31 14:58
nk12914:那可以請問福爾摩沙大~你的transfer條件是多少? 謝謝~ 08/31 16:57
alaric:考慮提高SDS-PAGE濃度至18%, 或是確定CBR後可以看到你要的 09/06 23:48
alaric:基本是每條bands 14kD附近, 最好要清晰可分辨. 09/06 23:50
anniepyng:semi-dry不適合transfer小分子蛋白,用濕式比較適合 09/09 15:02
formosana:400mA 20V 害怕過頭就加兩張membrane 09/12 23:02
formosana:之前有別的實驗室都壓不出來,結果是沒有用二次水配 09/12 23:06
windyflyer:我也有差不多的痛..可是我連GAPDH都爆炸了 囧 09/26 13:00