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我設計了一組 primer 並利用 Biomix 找到 Tm =56.6度 (基因size:787bp) 條件如下: 95度10min-->95度30s,56.6度1min,72度1min(40cycle)-->72度10min-->4度 結果...利用相同條件,只換 enzyme !!! 換成 High fidelity 就 P 不出來 >"< 原本想說可能是 high fidelity 有proof reading 的能力,需要 elongation 時間較長 所以我 elongation 的時間調成 10 min 結果也 P 不出來,學長說可能是 Tm 值太高, 所以我也試著改變 Tm 值 (改成53度) 還是一樣...跑完膠好乾淨 QQ 想請問各位有遇過這種事嗎?該怎麼解決?? -- 生命跟人惡作劇 他騙人化進故事理去活 他用種種的情節引誘著人熱烈的投入 人 先被故事捉進去了 然後 那個手麥田的稻草人 就上當又上當的講了又講 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 163.25.92.152
RickyKckao:你要P的序列是GC rich嗎? 可能你換的enzyme的buffer沒 08/28 15:03
RickyKckao:辦法解高GC 08/28 15:03
RickyKckao:比比看兩個enzyme跟buffer的差異 說不定有蛛絲馬跡@@ 08/28 15:04
crazybrian:High fidelity對於sample DNA濃度有差! 濃度不能太高 08/28 16:08
huuban:Tm56蠻低的,看你template是什麼吧 08/28 16:20
huuban:不同酵素要參考protocol,說不定它適合hot start? 08/28 16:21
huuban:也說不定它適合更高的Tm值,我們用的習慣都是58-60度 08/28 16:22
Realthugz:都設計在60度附近+1 08/28 16:43
lyu0001:tm 可以到66度都還ok 只要Primer夠長 08/29 00:50
lyu0001:加長primer應該比較有幫助 08/29 00:55
Ianthegood:primer影響最大 新primer我都先拉gradient 50-65 08/29 03:27
kikixie:謝謝大家我再試試看>< 08/29 14:29
DJHINN:95 度 10 min @"@? 是哪一家的啊 我 hot start 都 5 min 08/31 15:51
DJHINN:而已, 10 min 酵素還OK嗎 XDD 08/31 15:52
WinnieDad:我的hot start也是需要10分鐘,並非不常見吧。一輪30幾 08/31 22:26
WinnieDad:cycles的PCR跑下來,少說也需要兩個小時,Taq衰退也是比 08/31 22:27
WinnieDad:較後期的事。一開始95度C多五分鐘有差嗎?畢竟每個廠牌 08/31 22:28
WinnieDad:的hot start polymerase製程不同,依原廠說明時間即可。 08/31 22:29