[求救] Primer設計

[bbbjjj (wind)]

大家好 日前被老闆指派設計 Real time-PCR primer

去偵測出sample (tissue or cell)中target的表現量變化



想請問大家 若target為VEGFA 從NCBI搜尋中發現

它具有非常多種不同的transcript variant form

那我是要選擇哪一種form 來進行接下來的primer設計呢?


謝謝大家~


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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 122.121.251.85
→ mzac1b:你可以參考生技公司的產品來設計 會方便很多
→ mzac1b:設計引子還要考慮跨exon的問題 直接參考別人設計的
→ mzac1b:如taqman gene expression 的產品 整理的還不錯
→ bbbjjj:謝謝你 我會試試看~
推 qqmango:直接參考paper最快，但還是要blast試試
→ bbbjjj:謝謝 我試試看
→ Locutus:taqman probe的primer sequence可以查的到嗎?
推 davideason:商用販賣的引子 往往是不會給序列滴
推 jsi:http://medgen.ugent.be/rtprimerdb/index.php 這個databank可
→ jsi:參考看看
→ bbbjjj:謝謝大家的回答~
→ mzac1b:商用不給序列 不過他有整理起來 參考哪個序列
→ mzac1b:跨哪兩個exon 推薦引子位置 還是可省時間 雖然沒買...
→ mzac1b:因為若自己整理 光isoform一堆就有點頭痛
推 jabari:我都查qiagen的 他會寫是用哪一區或exon-exon 設計
→ jabari:如果你用R牌機器..可以跟業務要primer設計軟體..很好用喔~
→ bbbjjj:謝謝~~ 真的幫助很大