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想請問各位前輩 使用Trizol抽"植物"RNA時 在Agaross gel 上 28s:18s rRNA的比例有辦法到1.8~2.0嗎? 最近在做real-time PCR,但是biological repeat間的error bar很大 再想是否與RNA的品質有關 文獻上說rRNA的比例要到1.8~2.0 可是我們實驗室抽出來都只有1 >"< ......我們老師說磨的時候用力一點.....就會抽得比較好..... 可是我很懷疑啊~~~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 133.50.190.84
iceking:RNA超容易degrade 也許有關~ 04/01 18:27
huuban:是指QC的ratio嗎?那個有時候跟物種有關 04/01 18:30
huuban:磨得細應該是回收量比較大吧..個人認為只要有磨還是可以抽 04/01 18:31
emilylienya:磨到很細有用喔!以前Lab也碰過類似的問題 04/01 21:32
chougham:我會再用DNASE I處理~然後用PHENOL-CHLOROFORM萃一遍 04/01 21:55
hsin37:有做DNase處理跟再萃取,以吸光值來看是沒有問題>"<但是就 04/02 11:21
hsin37:好像被分解掉了~那磨sample是on ice嗎?ambion的protocol是 04/02 11:24
hsin37:常溫磨,我有點不太理解...這步會有很嚴重的影響嗎? 04/02 11:25
huuban:我習慣加液氮磨耶 04/02 13:23
huuban:你有gel圖可以讓大家看看嗎? 04/02 13:24
kunhan1013:液態氮磨 +1 04/11 14:26
oscarcc:你之後有用phenol/chloroform 嗎? 05/01 02:12
oscarcc:記得離心後不要吸到下層的有機層,祝順利 05/01 02:13