[求救] 植物抽RNA，沒看到18s跟28s

[Onagraceae (Epilobium)]

大家好

目前我們實驗室用tri reagent正在抽取植物 (樟科植物，富含醣類的一個類群)RNA
實驗步驟與trizol提供的一致
樣本是較年輕的葉片

但是完成步驟後
看不到18s跟28s rRNA的條帶
樣本的lane也沒什麼smear

但是在相對DNA marker 200-300bps之間，卻有一明顯條帶
看起來就像是5s rRNA的位置?


藥品應該沒有問題
我有嘗試抽取其他醣類比較沒那麼多的物種 (唇形科)
28s 18s跟5s都清楚可見

是因為醣類太多?
或有人有類似的問題否?

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※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) 
◆ From: 140.127.28.78
推 huuban:樣本跟reagent不合，抽植物很常碰到的問題
→ huuban:樟科植物尤其難抽，一般kit或reagent無法應付很正常~~
推 batatas:用CTAB抽?
→ huuban:CTAB應該可以，也可能還是很難抽就是了
→ Onagraceae:我好奇為何只有5s沈澱下來?
→ Onagraceae:我試過了，ctab可以抽，不過有很明顯的DNA殘留
→ huuban:再放DNase吃乾淨就好了
推 WinnieDad:作個RT-PCR一試便知抽RNA結果如何，除非你是要建立cDNA
→ WinnieDad:library，如果只是對少數genes有興趣，這種quality測試
→ WinnieDad:結果我都只當參考而已。