敝實驗室最近嘗試做permanganate footprinting
就是利用KMnO4會氧化T使其之後能被piperidine切斷的特性來偵測protein binding site
一般的footprinting都會接上istope-labeled primer進行LM-PCR
而小弟我想先用一般primer先試試看有沒有辦法有效P出東西
但不管怎樣做都只得到一堆smear的雜band卻無法在想要的位置看到很亮的PCR product
想請問一下是依定要用isotope-labeled的primer才看的到東西嗎?
或者是其他原因導致我無法得到產物?
感激不盡!
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